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如何使用python讀取DICOM頭文件-創(chuàng)新互聯(lián)

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Python是一種跨平臺(tái)的、具有解釋性、編譯性、互動(dòng)性和面向?qū)ο蟮哪_本語言,其最初的設(shè)計(jì)是用于編寫自動(dòng)化腳本,隨著版本的不斷更新和新功能的添加,常用于用于開發(fā)獨(dú)立的項(xiàng)目和大型項(xiàng)目。

用dicompyler軟件打開dicom圖像,頭文件如圖所示:

如何使用python讀取DICOM頭文件

當(dāng)然也可以直接讀取:

ds = dicom.read_file('H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\CT#0#21662#E7AB693D.dcm')
print ds
>>
(0008, 0008) Image Type       CS: ['ORIGINAL', 'SECONDARY', 'AXIAL']
(0008, 0016) SOP Class UID      UI: CT Image Storage
(0008, 0018) SOP Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501.0
(0008, 0020) Study Date       DA: '20170310'
(0008, 0021) Series Date       DA: '20170310'
(0008, 0023) Content Date      DA: '20060505'
(0008, 0030) Study Time       TM: '1942'
(0008, 0031) Series Time       TM: '1942'
(0008, 0033) Content Time      TM: ''
(0008, 0050) Accession Number     SH: '63071'
(0008, 0060) Modality       CS: 'CT'
(0008, 0070) Manufacturer      LO: 'NOMOS'
(0008, 0090) Referring Physician's Name   PN: ''
(0008, 1010) Station Name      SH: ''
(0008, 1090) Manufacturer's Model Name   LO: 'CORVUS 6.4'
(0010, 0010) Patient's Name      PN: '*M32-2^CHENJUN^^^'
(0010, 0020) Patient ID       LO: '21662'
(0010, 0030) Patient's Birth Date    DA: ''
(0010, 0040) Patient's Sex      CS: ''
(0018, 0050) Slice Thickness      DS: '4.75'
(0018, 0060) KVP         DS: '0'
(0018, 1020) Software Version(s)     LO: 'CORVUS 6.4'
(0018, 5100) Patient Position     CS: 'HFS'
(0020, 000d) Study Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701
(0020, 000e) Series Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501
(0020, 0010) Study ID       SH: '63071'
(0020, 0011) Series Number      IS: '0'
(0020, 0012) Acquisition Number     IS: '0'
(0020, 0013) Instance Number      IS: '0'
(0020, 0020) Patient Orientation     CS: ['L', 'P']
(0020, 0032) Image Position (Patient)   DS: ['0.73437356948853', '0', '3.25']
(0020, 0037) Image Orientation (Patient)   DS: ['1', '0', '0', '0', '1', '0']
(0020, 0052) Frame of Reference UID    UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.601
(0020, 0060) Laterality       CS: ''
(0020, 1040) Position Reference Indicator  LO: ''
(0020, 1041) Slice Location      DS: '3.25'
(0028, 0002) Samples per Pixel     US: 1
(0028, 0004) Photometric Interpretation   CS: 'MONOCHROME2'
(0028, 0010) Rows        US: 330
(0028, 0011) Columns        US: 339
(0028, 0030) Pixel Spacing      DS: ['0.734375', '0.734375']
(0028, 0100) Bits Allocated      US: 16
(0028, 0101) Bits Stored       US: 12
(0028, 0102) High Bit       US: 11
(0028, 0103) Pixel Representation    US: 0
(0028, 1052) Rescale Intercept     DS: '-1024'
(0028, 1053) Rescale Slope      DS: '1'
(7fe0, 0010) Pixel Data

發(fā)現(xiàn)一套圖的第一張和最后一張的Slice Thickness往往和中間層的值是不同的。

Path = 'H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\a.dcm'
slices = dicom.read_file(path)
spacing = slices.PixelSpacing

讀取頭文件信息方法:

Slices.上圖頭文件中的name列。

這時(shí)要注意的是,name大小寫不變,去掉空格,去掉符號(hào),比如括號(hào)。

舉例:

origin = slices.SoftwareVersions
print origin
>>CORVUS 6.4
spacing = slices[1].PixelSpacing
print spacing
>>['0.734375', '0.734375']

上述就是小編為大家分享的如何使用python讀取DICOM頭文件了,如果剛好有類似的疑惑,不妨參照上述分析進(jìn)行理解。如果想知道更多相關(guān)知識(shí),歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道。


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