在Linux系統(tǒng)里常用于文本查看、操作、統(tǒng)計(jì)的命令:
成都創(chuàng)新互聯(lián)服務(wù)項(xiàng)目包括九龍坡網(wǎng)站建設(shè)、九龍坡網(wǎng)站制作、九龍坡網(wǎng)頁(yè)制作以及九龍坡網(wǎng)絡(luò)營(yíng)銷策劃等。多年來,我們專注于互聯(lián)網(wǎng)行業(yè),利用自身積累的技術(shù)優(yōu)勢(shì)、行業(yè)經(jīng)驗(yàn)、深度合作伙伴關(guān)系等,向廣大中小型企業(yè)、政府機(jī)構(gòu)等提供互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)的解決方案,九龍坡網(wǎng)站推廣取得了明顯的社會(huì)效益與經(jīng)濟(jì)效益。目前,我們服務(wù)的客戶以成都為中心已經(jīng)輻射到九龍坡省份的部分城市,未來相信會(huì)繼續(xù)擴(kuò)大服務(wù)區(qū)域并繼續(xù)獲得客戶的支持與信任!
通過多敲鍵盤,形成手感 肌肉記憶 ,熟練掌握這些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每個(gè)命令的詳細(xì)的介紹(主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學(xué)習(xí)做的筆記)
接下來通過示例把10個(gè)命令的常用參數(shù)和用法展示出來:
參數(shù)的用法介紹:
注意事項(xiàng):
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 編輯文本 ,編輯文本要加 符號(hào),退出時(shí),另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看壓縮的文本文件,tac逆向查看
結(jié)合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默認(rèn) 10 行 (在R語(yǔ)言里head和tail默認(rèn)是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比較少
3.1 less命令
less [參數(shù)] 文件名
less命令重要的補(bǔ)充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q鍵
less命令重要的補(bǔ)充用法2 :
參數(shù)用法:
less命令 不加參數(shù) 查看文件:
less命令加 -N參數(shù) 查看文件:顯示行號(hào)
less命令加 -S參數(shù) 查看文件:?jiǎn)涡酗@示,非常規(guī)整
對(duì)比:less和cat命令顯示文本行號(hào)的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐頁(yè)查看,按空格翻頁(yè),按回車換行 ,more命令一般很少用,熟練掌握l(shuí)ess命令就好
查看壓縮文件
wc 統(tǒng)計(jì)字符是也把換行符統(tǒng)計(jì)進(jìn)去,但是別的命令不一定會(huì)把換行符算進(jìn)去,。
常見參數(shù):
切記:用less命令,按q退出
cut命令是按關(guān)鍵詞來切的
常見參數(shù):
排列前:
排列后:
解釋:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一個(gè)表格結(jié)構(gòu)時(shí),因?yàn)橹票矸麑?duì)齊的原因,出現(xiàn)一個(gè)錯(cuò)位的現(xiàn)象。還有 字典排序 可能和我們平時(shí)的認(rèn)知不一樣,所以 加上-n參數(shù) , 讓數(shù)值有數(shù)學(xué)意義上的大小來排序 。
uniq命令去重,只有兩行出現(xiàn)重復(fù),而且是相鄰的兩行,如果不相鄰,即使出現(xiàn)兩行一模一樣,不會(huì)去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
換其它文件試試
總之,uniq命令使用時(shí)經(jīng)常和sort一起
常見參數(shù):
常見用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常見用法2 : paste - -
常見參數(shù):
要養(yǎng)成一個(gè)好習(xí)慣,原始數(shù)據(jù)不要輕易修改,修改的東西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符傳遞給 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的內(nèi)容
3. 在第2步的基礎(chǔ)上截取分號(hào)分割的第1列
4. 在第3步的基礎(chǔ)上排序、去重復(fù)并統(tǒng)計(jì)
5. 在第4步的基礎(chǔ)上,將空格替換成制表符
補(bǔ)充小知識(shí) :
清屏 :control L
查看歷史(輸入過的)命令 :history
需要在終端中輸入命令進(jìn)行操作,打開終端有如下4種方法,建議你這樣試試看:
1. 快捷鍵,“Ctrl + Alt + T”, 打開終端,輸入命令,如 ls,
2. 點(diǎn)擊搜索計(jì)算機(jī),然后輸入終端,點(diǎn)擊,即可打開終端,
3. 進(jìn)入任意文件夾下,點(diǎn)擊右鍵,選擇“在終端打開”,即可打開該路徑下的終端,
4. 點(diǎn)擊桌面左側(cè)的終端快捷鍵,
然后在終端輸入linux命令,如:ls,whoami, pwd, 等等。
linux基本操作命令:pwd命令、cd命令、ls命令、cat命令、cp命令。
1、pwd命令
使用pwd命令找出您所在的當(dāng)前工作目錄的路徑。該命令將返回一個(gè)絕對(duì)(完整)路徑,該路徑基本上是所有以/開頭的目錄的路徑。絕對(duì)路徑的一個(gè)示例是/home/username。
2、cd命令
要瀏覽Linux文件和目錄,請(qǐng)使用cd命令。根據(jù)您所在的當(dāng)前工作目錄,它需要目錄的完整路徑或名稱。假設(shè)您位于/home/username/Documents中,并且想要轉(zhuǎn)到Documents的子目錄Photos。
3、ls命令
LS命令用于查看目錄的內(nèi)容。默認(rèn)情況下,此命令將顯示當(dāng)前工作目錄的內(nèi)容。如果要查看目錄的內(nèi)容,請(qǐng)鍵入ls,然后鍵入目錄的路徑。
4、cat命令
cat(連接的縮寫)是Linux中最常用的命令之一。它用于在標(biāo)準(zhǔn)輸出(sdout)上列出文件的內(nèi)容。要運(yùn)行此命令,請(qǐng)鍵入cat,然后輸入文件名及其擴(kuò)展名。
5、cp命令
使用cp命令將文件從當(dāng)前目錄復(fù)制到另一個(gè)目錄。例如,命令cpscenery.jpg/home /username/Pictures將在您的Pictures目錄中創(chuàng)建一個(gè)Scene.jpg副本(來自當(dāng)前目錄)。
[root@localhost ~]#
用戶 @ 主機(jī)名 當(dāng)前目錄
總結(jié)Linux命令輸入規(guī)律:
如何輸入命令:
命令 [選項(xiàng)]([參數(shù)])[選項(xiàng)的值]([參數(shù)的值])空格分割
常見選項(xiàng)(參數(shù)):-h --help ; 特點(diǎn):選項(xiàng)前有一個(gè) -字母 或 --加單詞
例:find /home -name mk
命令后:左邊是源 右邊是目標(biāo)
例:cp a.txt a.txt.bak
作用:查看目錄下的文檔
語(yǔ)法:ls 目錄
-l 顯示詳細(xì)信息
-a 顯示隱藏文件
. 當(dāng)時(shí)目錄
.. 上級(jí)目錄
-d 查看目錄
-h 增強(qiáng)可讀性
作用:查看當(dāng)前所在的路徑
語(yǔ)法:pwd
例:[root@iZ9403omxhxZ html]# pwd
/var/www/html
作用:切換目錄
語(yǔ)法:cd 目錄名
cd 回到用戶的家目錄
cd ~ 回到-用戶的家目錄
cd - 回到上級(jí)切換時(shí)目錄
切換到/etc下
[root@localhost html]# cd /etc/
切換到/etc/sysconfig/
[root@localhost sysconfig]# cd /etc/sysconfig/
-h --help
man find
shutdow、init 、reboot
作用:關(guān)機(jī),重啟,定時(shí)關(guān)機(jī)
-r #重啟
-h #關(guān)機(jī)
-h +2 # 2分鐘后關(guān)機(jī)
-c
shutdown -h 22:00
作用:切換系統(tǒng)級(jí)別
語(yǔ)法:init 0~6
init 0命令用于立即將系統(tǒng)運(yùn)行級(jí)別切換為0,即關(guān)機(jī);
init 6命令用于將系統(tǒng)運(yùn)行級(jí)別切換為6,即重新啟動(dòng)。
0是關(guān)機(jī)
1是單用戶
2是多用戶,不聯(lián)網(wǎng)
3是多用戶
4是不使用的
5是xwindows,也就是有界面的
6是重啟
自己去查下reboot怎么使用吧,這里就不過多介紹了reboot --help
[root@localhost~]# runlevel
N 3
語(yǔ)法:
ln(選項(xiàng))(參數(shù))
它的功能是為某一個(gè)文件在另外一個(gè)位置建立一個(gè)同不的鏈接,這個(gè)命令最常用的參數(shù)是-s,具體用法是:ln –s 源文件 目標(biāo)文件。
在此我們只介紹下軟鏈接。
我們?yōu)閖s文件夾建一個(gè)軟鏈接
我們?yōu)?var/www/html/forestry/js/ 在/root/目錄下建立一個(gè)名叫js2的軟鏈接。
圖中我們可以看到j(luò)s2的連接目錄是/var/www/html/forestry/js/