系統(tǒng)集成的項目通常比較大，耗時比較長，專業(yè)的系統(tǒng)集成服務商并不是從接到訂單就一直要等到訂單全部完成后，才向客戶收取費用。而是，在系統(tǒng)集成項目的計劃和進行階段，按比例收取費用。

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一般來說，計算機信息系統(tǒng)集成的服務費由以下部分組成：

1、 項目計劃階段費用：應包括可行性論證、需求預測、預算評估、咨詢服務、環(huán)境分析、招投標等相應費用。當此階段的工作完成，系統(tǒng)集成服務公司可以根據(jù)這部分費用占總費用的比例，向客戶收取服務費。通常占5%-10%左右。

2、 項目規(guī)劃設計階段費用：應包括需求管理、信息資源規(guī)劃(概念設計)、設計方案(詳細設計)、實施規(guī)劃、規(guī)劃設計論證等相應費用。當系統(tǒng)集成公司完成了當此階段的工作，系統(tǒng)集成服務公司可以根據(jù)這部分費用占總費用的比例，要求客戶付款。通常占5%-10%左右。

3、 工程階段費用：應包括安裝費用、人工費用、施工現(xiàn)場發(fā)生費用及信息服務管理單位的管理費用、財務管理費用、計劃利潤、上繳利稅等直接和間接費用。這部分的費用占總費用的大頭，當系統(tǒng)集成公司完成了當此階段的工作并經(jīng)過驗收，系統(tǒng)集成服務公司可以根據(jù)這部分費用占總費用的比例，向客戶收取服務費。

4、 風險費用：項目實施過程中可能發(fā)生內(nèi)部或外部風險時的應對費用。這部分費用系統(tǒng)集成公司會按工程進展度分比例進行收取服務費。

5、 項目監(jiān)理費用：應依據(jù)《信息服務資費標準·信息化工程監(jiān)理類》預算項目監(jiān)理費用。這部分費用系統(tǒng)集成公司會按工程進展度分比例進行收取服務費。

6、 項目驗收階段費用：應包括項目測試、項目階段驗收、項目試運行、項目總體驗收等相應費用。當系統(tǒng)集成項目工程已經(jīng)完成，并被客戶驗收無問題后，系統(tǒng)集成服務商可向客戶收取剩下的服務費。

7、 其它費用：在項目實施過程中，根據(jù)項目需要，或為應對突發(fā)事件所需相應費用。這部分費用可以視具體情況而定，在需要時，可與客戶溝通，要求支付。

這樣一來，系統(tǒng)集成的服務費通過工作的完成階段分比例收取，不僅對系統(tǒng)集成公司有利，以便更好地與客戶溝通下一步工作，同時，對它們的服務對象有利，可分階段檢驗它們的工作。