這篇文章主要講解了“circos images怎么使用”，文中的講解內(nèi)容簡(jiǎn)單清晰，易于學(xué)習(xí)與理解，下面請(qǐng)大家跟著小編的思路慢慢深入，一起來研究和學(xué)習(xí)“circos images怎么使用”吧！

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image這個(gè)block是circos內(nèi)置的block之一，其配置文件為軟件安裝目錄下的etc/image.conf。內(nèi)容為

默認(rèn)的image的配置由兩個(gè)文件決定

1. image.generic.conf

2. background.white.conf

image.generic.conf文件內(nèi)容如下

包含以下幾個(gè)屬性

1. dir
   dir指定生成的圖片的目錄，.代表當(dāng)前目錄

2. file
   file指定生成的圖片的名字，默認(rèn)為circos.png

3. png
   png指定生成的圖片的格式，yes代表生成png格式的圖片

4. svg
svg指定生成的圖片的格式，yes代表生成svg格式的圖片

5. radius
   radius指定圖片半徑的大小，由于circos是圓形布局，所以用圓的半徑來控制圖片大小，生成的圖片是正方形的，邊長(zhǎng)為2 * radius

6. angle_offset
   angle_offset指定起始染色體的偏移角度，默認(rèn)起始的角度為0度，對(duì)應(yīng)表盤上3點(diǎn)鐘位置，angle_offset = -90 , 第一條染色體位于表盤上12點(diǎn)鐘位置，

7. auto_alpha_colors
   auto_alpha_colors代筆對(duì)顏色添加透明度，在原來RGB顏色的基礎(chǔ)上，添加一個(gè)alpha透明度屬性，

8. auto_alpha_step
   auto_alpha_step指定透明度的大小，取值范圍0-100, 默認(rèn)值為5

background.white.conf文件只有一行內(nèi)容

background = white

指定生成的圖片的背景色，可以看到這里為白色，所以默認(rèn)生成的圖片背景色都為白色。

在使用時(shí)，我們通常只調(diào)用系統(tǒng)內(nèi)置的image的配置文件就可以了，寫法如下

此時(shí)image的相關(guān)配置就是系統(tǒng)默認(rèn)配置，當(dāng)我們想要改變其中某項(xiàng)默認(rèn)配置時(shí)，比如修改背景色為黑色，需要使用*操作符，示例如下

在想要修改的參數(shù)后面添加*, 然后重新賦值即可。

對(duì)于background, 有兩點(diǎn)需要注意

1.背景色可以設(shè)置成透明

寫法如下

background = transparent

2.背景除了可以是顏色之外，也可以是另外一幅圖

寫法如下：

background = background.png

要求背景圖片的格式必須為png，而且大小必須和輸出圖片的大小完全一致。

最后看一個(gè)更換背景色的例子

感謝各位的閱讀，以上就是“circos images怎么使用”的內(nèi)容了，經(jīng)過本文的學(xué)習(xí)后，相信大家對(duì)circos images怎么使用這一問題有了更深刻的體會(huì)，具體使用情況還需要大家實(shí)踐驗(yàn)證。這里是創(chuàng)新互聯(lián)，小編將為大家推送更多相關(guān)知識(shí)點(diǎn)的文章，歡迎關(guān)注！