這篇文章給大家分享的是有關(guān)HMDD數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用的內(nèi)容。小編覺(jué)得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個(gè)參考，一起跟隨小編過(guò)來(lái)看看吧。

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HMDD是一個(gè)手工收集整理的miRNA與疾病相關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)庫(kù)，最新版本為V3.0，網(wǎng)址如下

http://www.cuilab.cn/hmdd

共包含1102個(gè)miRNA基因，850種疾病，32281個(gè)miRNA與疾病的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)，對(duì)于每個(gè)miRNA與疾病之間的關(guān)聯(lián)，都有對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)，會(huì)給出pubmed ID。

通過(guò)Browse功能，可以從miRNA和disease兩個(gè)角度出發(fā)，查看該數(shù)據(jù)庫(kù)中的內(nèi)容

1. miRNA

hsa-let-7的結(jié)果示意如下

2. disease

Anemia疾病的結(jié)果示意如下

處理miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián)，利用文獻(xiàn)中的數(shù)據(jù)，還整理出了miRNA對(duì)應(yīng)的靶基因數(shù)據(jù)，并提供了miRNA-target gene的網(wǎng)絡(luò)圖，既可以分析單個(gè)miRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，也支持某種疾病中的miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，示意如下

圖例如下所示

藍(lán)色節(jié)點(diǎn)代表gene, 其他顏色的節(jié)點(diǎn)代表miRNA, 綠色表示該miRNA在患病者中上調(diào)，紅色代表下調(diào)，灰色代表不確定miRNA的表達(dá)趨勢(shì)，紅色連線代表負(fù)調(diào)控作用，綠色連線代表正調(diào)控作用。

該數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)是可以免費(fèi)下載的，通過(guò)該數(shù)據(jù)庫(kù)，我們可以快速得到miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián)。

感謝各位的閱讀！關(guān)于“HMDD數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助，讓大家可以學(xué)到更多知識(shí)，如果覺(jué)得文章不錯(cuò)，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！