miRNA靶基因查詢R包和網(wǎng)頁工具該怎么使用，很多新手對(duì)此不是很清楚，為了幫助大家解決這個(gè)難題，下面小編將為大家詳細(xì)講解，有這方面需求的人可以來學(xué)習(xí)下，希望你能有所收獲。

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我們多次介紹了關(guān)于miRNA的靶向基因的查詢工具，但是不少粉絲表示不明白這些東西是做什么的，現(xiàn)在就給一個(gè)示例，你把癌癥替換成為TCGA的另外33種癌癥，都是類似的分析策略，類似的寫作思路。

這樣的文章，你直接定位到材料與方法即可：

• The DEMs targeted by DEMIs were identified and the negative correlation between DEMs and DEMIs was subjected to visualization.
• The potential functions of DEMs targeted by DEMIs were annotated in Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database.
• A total of 663 dysregulated DEMs (449 upregulated and 214 downregulated) and 33 DEMIs (24 upregulated and 8 downregulated) were identified in LSCC compared with normal controls.
• 502 negative correlations between DEMIs and DEMs were identified and subjected to construct interaction network.

分別對(duì)mRNA和miRNA的表達(dá)矩陣，進(jìn)行差異分析，分別拿到上下調(diào)的mRNA和miRNA的集合。然后使用miRWalk2來查詢mRNA和miRNA的調(diào)控關(guān)系，輸入數(shù)據(jù)是32個(gè)有差異的miRNA，預(yù)測(cè)到的這些靶mRNA，跟前面的差異MRNA進(jìn)行交集，最后剩下502個(gè)mRNA和miRNA的調(diào)控關(guān)系。全文主要是差異分析的基因列表，熱圖以及mRNA和miRNA的的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。我們介紹的關(guān)于miRNA的靶向基因的查詢工具，就在這里發(fā)揮了作用！

miRNA的靶向基因的查詢工具

也就是說，差異分析單純的作為數(shù)據(jù)挖掘的賣點(diǎn)已經(jīng)不夠了，   早先可以走PPI網(wǎng)絡(luò)加上hub基因路線，現(xiàn)在可以走miRNA及其靶基因網(wǎng)絡(luò)路線。每個(gè)miRNA調(diào)控的基因，就可以網(wǎng)絡(luò)圖可視化如下：

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當(dāng)前名稱：miRNA靶基因查詢R包和網(wǎng)頁工具該怎么使用
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