怎么用R語言ggplot2散點圖并添加擬合曲線和置信區(qū)間,相信很多沒有經(jīng)驗的人對此束手無策,為此本文總結了問題出現(xiàn)的原因和解決方法,通過這篇文章希望你能解決這個問題。
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今天的內(nèi)容是補充材料Fig4中的小a中的第三個小圖
數(shù)據(jù)準備好是如下格式
需要示例數(shù)據(jù)可以直接在文末留言
mydf<-read.csv("Single_Cell/covid_metadata_c.csv",header=T,row.names = 1)
dim(mydf)
mydf
這里作圖用到的是ggscatter()
函數(shù),這個函數(shù)來自ggpubr
這個包。
library(ggpubr)
ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG")
這里需要注意的是想x,y后面跟著的值需要加雙引號
p1<-ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG",
add = "reg.line")
p2<-ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG",
add = "reg.line",
conf.int = T)
p3<-ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG",
add = "reg.line",
conf.int = T)+
labs(y = "Mean ISG module score",
x = "Days post-symptom onset")
p4<-ggscatter(mydf,x="DPS",y="ISG",
add = "reg.line",
conf.int = T)+
labs(y = "Mean ISG module score",
x = "Days post-symptom onset")+
stat_cor(label.x = 8, label.y = 0.2)
ggarrange(p1,p2,p3,p4,
ncol = 2,
nrow = 2,
labels = c("p1","p2","p3","p4"))
最終的結果如下