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如何進(jìn)行R代碼調(diào)試

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R語言編程,簡單的R代碼調(diào)試,其實(shí)靠head,str,help函數(shù)即可。所以我從強(qiáng)調(diào)初學(xué)者應(yīng)該是要至少把這3個(gè)函數(shù)敲1000遍以上。比如,群里有人問它的表達(dá)矩陣?yán)锩娴奶结業(yè)D,跟他準(zhǔn)備好的探針I(yè)D與基因?qū)?yīng)表格, 無法匹配,自己在Excel手動搜索,明明是每一個(gè) 探針都存在于準(zhǔn)備好的探針I(yè)D與基因?qū)?yīng)表格里面。

如何進(jìn)行R代碼調(diào)試

探針I(yè)D與基因?qū)?yīng)表格

我讓他把兩個(gè)數(shù)據(jù)保存為rdata給我,我寫代碼檢查了一下:

rm(list = ls())   
load('input.Rdata')
head(ids)
exprSet[1:4,1:4]
head(rownames(exprSet))
rownames(exprSet)=gsub('"','',rownames(exprSet))
head(rownames(exprSet))
 
其實(shí)我就是簡簡單單的使用了head函數(shù),就調(diào)試出來了。
不過,也有高級調(diào)試工具debugging tools,比如一些   R中的調(diào)試函數(shù) 
  • traceback 函數(shù)
  • debug 函數(shù)
  • browser 函數(shù)
  • trace 函數(shù)
  • recover 函數(shù)
另外,很多開發(fā)者在編寫其R包的函數(shù)里面,也會加入3種用戶交互信息:
  • message:由message()函數(shù)產(chǎn)生
  • warning:由warning()函數(shù)產(chǎn)生
  • error:由stop()函數(shù)產(chǎn)生 

看完上述內(nèi)容,你們掌握如何進(jìn)行R代碼調(diào)試的方法了嗎?如果還想學(xué)到更多技能或想了解更多相關(guān)內(nèi)容,歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道,感謝各位的閱讀!


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