這篇文章將為大家詳細(xì)講解有關(guān)3CDB數(shù)據(jù)庫有什么用，小編覺得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個(gè)參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

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3CDB是一個(gè)染色質(zhì)空間互作的數(shù)據(jù)庫，根據(jù)特定的關(guān)鍵詞從pubmed數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行文獻(xiàn)檢索，查找基于3C技術(shù)研究染色質(zhì)互作的文獻(xiàn)，并從中提取染色質(zhì)互作信息。

數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下

http://3cdb.big.ac.cn/index.jsp

收錄了來自17個(gè)物種，共3319個(gè)染色質(zhì)片段互作信息。不同物種數(shù)據(jù)量分布如下

3C實(shí)驗(yàn)涉及到的DNA內(nèi)切酶分布如下

通過首頁的Data Browser菜單，可以從以下四個(gè)方面瀏覽該數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)容

1. Species

2. Cell line

3. Enzyme

4. Gene

以物種為例，界面如下所示

點(diǎn)擊物種對應(yīng)的Locus, 可以查看具體的互作信息列表，結(jié)果示意如下

點(diǎn)擊第一列的編號，可以查看詳細(xì)信息，示意如下

給出了對應(yīng)的細(xì)胞系，內(nèi)切酶，引物，文獻(xiàn)等詳細(xì)信息。該數(shù)據(jù)庫中的信息是可以免費(fèi)下載的，鏈接如下

http://3cdb.big.ac.cn/pages/download.jsp

通過該數(shù)據(jù)庫，可以獲得高可信度的染色質(zhì)互作信息。

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