在Linux C語言下，可執(zhí)行的Shell腳本文件與編譯之后的C可執(zhí)行文件的區(qū)別有哪些 ？

shell腳本是shell的一種擴展功能，也就是shell會根據(jù)你所寫的腳本一條一條的去執(zhí)行，C寫的程序是直接給CPU執(zhí)行的。一般來說做一些簡單功能，特別是和shell有關的。我們會用shell腳本，如系統(tǒng)環(huán)境的設定，開機后執(zhí)行系統(tǒng)的初始化等。做一些功能復雜的，特別人用戶自已所想到的功能時會用C語。另外如果程序執(zhí)行是要用到root權限是最好也用C語。

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（1）Shell腳本與Windows/Dos下的批處理相似，也就是用各類命令預先放入到一個文件中，方便一次性執(zhí)行的一個程序文件，主要是方便管理員進行設置或者管理用的。但是它比Windows下的批處理更強大，比用其他編程程序編輯的程序效率更高，它使用了Linux/Unix下的命令。

（2）C語言的設計目標是提供一種能以簡易的方式編譯、處理低級存儲器、產生少量的機器碼以及不需要任何運行環(huán)境支持便能運行的編程語言。

linux shell腳本 批處理

新建一個文件，名字為test(自己定義的名字)

nano test.sh

在里面編寫腳本

?程序必須以下面的行開始（必須方在文件的第一行）：

?#!/bin/sh

符號#!用來告訴系統(tǒng)它后面的參數(shù)是用來執(zhí)行該文件的程序。在這個例子中使用/bin/sh來執(zhí)行程序。

(能寫一些shell普通命令，命令用分號隔開)

例子：

#! /bin/bash

# shutdown pc

sudo

shutdown +1

執(zhí)行方法

(1)在控制臺輸入命令執(zhí)行：

sh

test.sh

(2)先給腳本可執(zhí)行權限，雙擊執(zhí)行：

右鍵此文件，選擇屬性－權限，最下方會有一個“允許以程序執(zhí)行文件”，將這一項勾選，就可以了。

或在命令行下附予權限：

chmod 777

test.sh 或： chmod +x test.sh

學生信的那些事兒之七 - Linux基礎之Shell腳本編程

沿著前面的軌跡，接下來是Linux中shell腳本的學習。這對于生信工程師后續(xù)處理大量 (海量更合適些) 數(shù)據(jù)是非常非常重要的，但是同樣的，作為一個有點古板的人，對于"腳本"是什么意思我都死磕了好久。主要覺得有些抽象，尤其是跟生信的同事討論項目分析部分的問題時，他們經常會說道這個詞，在他們意識里這是個不言自明的術語，殊不知對外行人而言 (比如我)，那簡直就是無情的"知識的詛咒"。經常是我假裝聽懂了，然后繼續(xù)討論下面的問題，形成一個模糊的印象。

百度上的解釋是：腳本（Script）是一種批處理文件的延伸，是一種純文本保存的程序，一般來說的計算機腳本程序是確定的一系列控制計算機進行運算操作動作的組合，在其中可以實現(xiàn)一定的邏輯分支等。不知道你能不能看懂，反正我開始的時候真是一知半解。

鳥哥私房菜的解釋是：shell script是利用 shell 的功能所寫的一個"程序"，這個程序是使用純文本文件，將一些shell的語法與命令(含外部命令)寫在里面，搭配正則表達式、管道命令與數(shù)據(jù)流重定向等功能，以達到我們所想要的處理的目的。不明覺厲，好像更看不懂了···

Jude 的簡單粗暴大白話解釋是：腳本就是Linux中很多命令按照一定規(guī)則的組合，以實現(xiàn)某個特定的功能。Linux中有很多簡單的命令，往往只是進行了簡單的對話，比如 cd 就是進入到某個目錄，簡單直接。但是如果我想進入某個目錄A，然后在目錄A中創(chuàng)建目錄B，再在目錄B中創(chuàng)建文本C呢？當然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用腳本，把三個命令寫在一起，一起執(zhí)行。好像有點啰嗦···

或者從英語的角度去理解，腳本的對應英文是Script，而這個單詞的中文釋義中還有劇本的意思。劇本就好理解了啊，劇本就是導演(生信工程師)基于某個主旨(要實現(xiàn)的目標)按照一定的手法(規(guī)則)所寫的一個故事。不管是哪個演員，都得按照劇本演。所以，學好英語對于生信也是有幫助的~

按照腳本的復雜程度可以分為：

這個無需多說，其實就是若干個簡單命令的順序排列，執(zhí)行腳本后會按照命令的前后關系從前往后一一執(zhí)行。

相對于簡單的基本腳本，結構化的命令腳本可以施加邏輯流程控制，從而改變程序(命令)執(zhí)行的順序?；灸_本中的命令就是從上往下執(zhí)行，但是結構化的命令腳本可以根據(jù)邏輯判斷重復或者跳過某些命令。

常用的結構化命令(語句)有：

后面還有什么嵌套循環(huán)啊啥的，不過我覺得上面的7中命令學到家了，應該可以應付大部分在生信分析里面的應用了。

記得高中的時候，物理老師(也是班主任)在給我們講解習題時有個有意思的套路：不管什么難題現(xiàn)在下面寫個"答："，以示自己解決問題的決心，也是一種正向的心理暗示。腳本編寫也是有套路的，不過總的來說還是比較簡單。

對于簡單的腳本(超級簡單的那種)，直接幾個命令連在一起即可，中間用"；"隔開。

對于更長更復雜的腳本，一般需要創(chuàng)建一個文本，并在里面編輯。這就涉及到了文本編輯器，比較常用和簡單的一般有nano和vim，實在很簡單，規(guī)則也容易理解，教程隨手可得，不多說。

比如用vim創(chuàng)建了一個腳本之后，具體的語法(套路)：

ok，腳本寫完了，怎么讓腳本開始工作呢？這有涉及到之前講過的環(huán)境變量和相對路徑、絕對路徑了。方法有三：

就這么多吧，應該有點感覺到了，剩下的就是狂練狂練了~