在Linux系統(tǒng)里常用于文本查看、操作、統(tǒng)計的命令：
公司主營業(yè)務：成都做網(wǎng)站、成都網(wǎng)站建設、移動網(wǎng)站開發(fā)等業(yè)務。幫助企業(yè)客戶真正實現(xiàn)互聯(lián)網(wǎng)宣傳，提高企業(yè)的競爭能力。創(chuàng)新互聯(lián)是一支青春激揚、勤奮敬業(yè)、活力青春激揚、勤奮敬業(yè)、活力澎湃、和諧高效的團隊。公司秉承以“開放、自由、嚴謹、自律”為核心的企業(yè)文化，感謝他們對我們的高要求，感謝他們從不同領域給我們帶來的挑戰(zhàn)，讓我們激情的團隊有機會用頭腦與智慧不斷的給客戶帶來驚喜。創(chuàng)新互聯(lián)推出沅江免費做網(wǎng)站回饋大家。
通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）
接下來通過示例把10個命令的常用參數(shù)和用法展示出來：
參數(shù)的用法介紹：
注意事項：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看
結合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比較少
3.1 less命令
less [參數(shù)] 文件名
less命令重要的補充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵
less命令重要的補充用法2 ：
參數(shù)用法：
less命令 不加參數(shù) 查看文件：
less命令加 -N參數(shù) 查看文件：顯示行號
less命令加 -S參數(shù) 查看文件：單行顯示，非常規(guī)整
對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好
查看壓縮文件
wc 統(tǒng)計字符是也把換行符統(tǒng)計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。
常見參數(shù):
切記：用less命令，按q退出
cut命令是按關鍵詞來切的
常見參數(shù):
排列前：
排列后：
解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一個表格結構時，因為制表符對齊的原因，出現(xiàn)一個錯位的現(xiàn)象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數(shù) ， 讓數(shù)值有數(shù)學意義上的大小來排序 。
uniq命令去重，只有兩行出現(xiàn)重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現(xiàn)兩行一模一樣，不會去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
換其它文件試試
總之，uniq命令使用時經常和sort一起
常見參數(shù):
常見用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常見用法2 : paste - -
常見參數(shù):
要養(yǎng)成一個好習慣，原始數(shù)據(jù)不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符傳遞給 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的內容
3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列
4. 在第3步的基礎上排序、去重復并統(tǒng)計
5. 在第4步的基礎上，將空格替換成制表符
補充小知識 ：
清屏 ：control L
查看歷史（輸入過的）命令 ：history
Linux運維人員必會的120個命令
來自《跟老男孩學Linux運維：核心系統(tǒng)命令實戰(zhàn)》一書
前言
第1章 Linux命令行簡介 / 1
1.1Linux命令行概述 / 1
1.2在Linux命令行下查看命令幫助 / 4
1.3Linux shutdown reboot halt / 9
關機：
shutdown -h now
halt
init 0
第2章 文件和目錄操作命令 / 13
2.1pwd：顯示當前所在的位置 / 13
2.2cd：切換目錄 / 16
2.3tree：以樹形結構顯示目錄下的內容 / 18
2.4mkdir：創(chuàng)建目錄 / 22
2.5touch：創(chuàng)建空文件或改變文件的時間戳屬性 / 27
2.6ls：顯示目錄下的內容及相關屬性信息 / 30
2.7cp：復制文件或目錄 / 39
2.8mv：移動或重命名文件 / 42
2.9rm：刪除文件或目錄 / 45
2.10rmdir：刪除空目錄 / 48
2.11ln：硬鏈接與軟鏈接 / 49
2.12readlink：查看符號鏈接文件的內容 / 54
2.13find：查找目錄下的文件 / 55
2.14xargs：將標準輸入轉換成命令行參數(shù) / 68
2.15rename：重命名文件 / 71
2.16basename：顯示文件名或目錄名 / 72
2.17dirname：顯示文件或目錄路徑 / 72
2.18chattr：改變文件的擴展屬性 / 73
2.19lsattr：查看文件擴展屬性 / 75
2.20file：顯示文件的類型 / 76
2.21md5sum：計算和校驗文件的MD5值 / 77
2.22chown：改變文件或目錄的用戶和用戶組 / 80
2.23chmod：改變文件或目錄權限 / 81
2.24chgrp：更改文件用戶組 / 85
2.25umask：顯示或設置權限掩碼 / 86
2.26老男孩從新手成為技術大牛的心法 / 90
第3章 文件過濾及內容編輯處理命令 / 91
3.1cat：合并文件或查看文件內容 / 91
3.2tac：反向顯示文件內容 / 103
3.3more：分頁顯示文件內容 / 104
3.4less：分頁顯示文件內容 / 107
3.5head：顯示文件內容頭部 / 109
3.6tail：顯示文件內容尾部 / 111
3.7tailf：跟蹤日志文件 / 114
3.8cut：從文本中提取一段文字并輸出 / 115
3.9split：分割文件 / 117
3.10paste：合并文件 / 118
3.11sort：文本排序 / 123
3.12join：按兩個文件的相同字段合并 / 127
3.13uniq：去除重復行 / 129
3.14wc：統(tǒng)計文件的行數(shù)、單詞數(shù)或字節(jié)數(shù) / 131
3.15iconv：轉換文件的編碼格式 / 133
3.16dos2unix：將DOS格式文件轉換成UNIX格式 / 134
3.17diff：比較兩個文件的不同 / 135
3.18vimdiff：可視化比較工具 / 138
3.19rev：反向輸出文件內容 / 139
3.20tr：替換或刪除字符 / 140
3.21od：按不同進制顯示文件 / 143
3.22tee：多重定向 / 145
3.23vi/vim：純文本編輯器 / 147
3.24老男孩逆襲思想：做Linux運維的多個好處 / 152
第4章 文本處理三劍客 / 153
4.1grep：文本過濾工具 / 153
4.2sed：字符流編輯器 / 159
4.3awk基礎入門 / 165
第5章 Linux信息顯示與搜索文件命令 / 176
5.1uname：顯示系統(tǒng)信息 / 176
5.2hostname：顯示或設置系統(tǒng)的主機名 / 178
5.3dmesg：系統(tǒng)啟動異常診斷 / 179
5.4stat：顯示文件或文件系統(tǒng)狀態(tài) / 181
5.5du：統(tǒng)計磁盤空間使用情況 / 183
5.6date：顯示與設置系統(tǒng)時間 / 186
5.7echo：顯示一行文本 / 190
5.8watch：監(jiān)視命令執(zhí)行情況 / 193
5.9which：顯示命令的全路徑 / 195
5.10whereis：顯示命令及其相關文件全路徑 / 196
5.11locate：快速定位文件路徑 / 197
5.12updatedb：更新mlocate數(shù)據(jù)庫 / 199
5.13老男孩逆襲思想：新手在工作中如何問問題不會被鄙視 / 200
第6章 文件備份與壓縮命令 / 201
6.1tar：打包備份 / 201
6.2gzip：壓縮或解壓文件 / 208
6.3zip：打包和壓縮文件 / 211
6.4unzip：解壓zip文件 / 212
6.5scp：遠程文件復制 / 214
6.6rsync：文件同步工具 / 216
6.7老男孩逆襲思想：新手如何高效地提問 / 220
第7章 Linux用戶管理及用戶信息查詢命令 / 222
7.1 useradd：創(chuàng)建用戶 / 222
7.2usermod：修改用戶信息 / 227
7.3userdel：刪除用戶 / 229
7.4groupadd：創(chuàng)建新的用戶組 / 230
7.5groupdel：刪除用戶組 / 231
7.6passwd：修改用戶密碼 / 232
7.7chage:修改用戶密碼有效期 / 237
7.8chpasswd：批量更新用戶密碼 / 238
7.9su：切換用戶 / 240
7.10visudo：編輯sudoers文件 / 242
7.11sudo：以另一個用戶身份執(zhí)行命令 / 244
7.12id：顯示用戶與用戶組的信息 / 248
7.13w：顯示已登錄用戶信息 / 249
7.14who：顯示已登錄用戶信息 / 250
7.15users：顯示已登錄用戶 / 252
7.16whoami：顯示當前登錄的用戶名 / 253
7.17last：顯示用戶登錄列表 / 253
7.18lastb：顯示用戶登錄失敗的記錄 / 254
7.19lastlog：顯示所有用戶的最近登錄記錄 / 255
第8章 Linux磁盤與文件系統(tǒng)管理命令 / 257
8.1fdisk：磁盤分區(qū)工具 / 257
8.2partprobe：更新內核的硬盤分區(qū)表信息 / 265
8.3tune2fs：調整ext2/ext3/ext4文件系統(tǒng)參數(shù) / 266
8.4parted：磁盤分區(qū)工具 / 268
8.5mkfs：創(chuàng)建Linux文件系統(tǒng) / 272
8.6dumpe2fs：導出ext2/ext3/ext4文件系統(tǒng)信息 / 274
8.7resize2fs：調整ext2/ext3/ext4文件系統(tǒng)大小 / 275
8.8fsck：檢查并修復Linux文件系統(tǒng) / 278
8.9dd：轉換或復制文件 / 281
8.10mount：掛載文件系統(tǒng) / 284
8.11umount：卸載文件系統(tǒng) / 288
8.12df：報告文件系統(tǒng)磁盤空間的使用情況 / 289
8.13mkswap：創(chuàng)建交換分區(qū) / 293
8.14swapon：激活交換分區(qū) / 294
8.15swapoff：關閉交換分區(qū) / 295
8.16sync：刷新文件系統(tǒng)緩沖區(qū) / 296
第9章 Linux進程管理命令 / 298
9.1ps：查看進程 / 298
9.2pstree：顯示進程狀態(tài)樹 / 305
9.3pgrep：查找匹配條件的進程 / 306
9.4kill：終止進程 / 307
9.5killall：通過進程名終止進程 / 310
9.6pkill：通過進程名終止進程 / 311
9.7top：實時顯示系統(tǒng)中各個進程的資源占用狀況 / 313
9.8nice：調整程序運行時的優(yōu)先級 / 320
9.9renice：調整運行中的進程的優(yōu)先級 / 323
9.10nohup：用戶退出系統(tǒng)進程繼續(xù)工作 / 324
9.11strace：跟蹤進程的系統(tǒng)調用 / 325
9.12ltrace：跟蹤進程調用庫函數(shù) / 332
9.13runlevel：輸出當前運行級別 / 334
9.14init：初始化Linux進程 / 335
9.15service：管理系統(tǒng)服務 / 335
第10章 Linux網(wǎng)絡管理命令 / 338
10.1ifconfig：配置或顯示網(wǎng)絡接口信息 / 338
10.2ifup：激活網(wǎng)絡接口 / 343
ifup eth0
10.3ifdown：禁用網(wǎng)絡接口 / 343
ifdown eth0
service network restart（/etc/init.d/network restart） 激活整個網(wǎng)絡，所有網(wǎng)卡。
10.4route：顯示或管理路由表 / 344
10.5arp：管理系統(tǒng)的arp緩存 / 350
10.6ip：網(wǎng)絡配置工具 / 351
10.7netstat：查看網(wǎng)絡狀態(tài) / 358
10.8ss：查看網(wǎng)絡狀態(tài) / 362
10.9ping：測試主機之間網(wǎng)絡的連通性 / 363
10.10traceroute：追蹤數(shù)據(jù)傳輸路由狀況 / 366
10.11arping：發(fā)送arp請求 / 367
10.12telnet：遠程登錄主機 / 369
10.13nc：多功能網(wǎng)絡工具 / 370
10.14ssh：安全地遠程登錄主機 / 373
10.15wget：命令行下載工具 / 376
10.16mailq：顯示郵件傳輸隊列 / 379
10.17mail：發(fā)送和接收郵件 / 381
10.18nslookup：域名查詢工具 / 386
10.19dig：域名查詢工具 / 389
10.20host：域名查詢工具 / 393
10.21nmap：網(wǎng)絡探測工具和安全/端口掃描器 / 394
10.22tcpdump：監(jiān)聽網(wǎng)絡流量 / 398
第11章 Linux系統(tǒng)管理命令 / 407
11.1lsof：查看進程打開的文件 / 407
11.2uptime：顯示系統(tǒng)的運行時間及負載 / 411
11.3free：查看系統(tǒng)內存信息 / 411
11.4iftop：動態(tài)顯示網(wǎng)絡接口流量信息 / 413
11.5vmstat：虛擬內存統(tǒng)計 / 415
11.6mpstat：CPU信息統(tǒng)計 / 419
11.7iostat：I/O信息統(tǒng)計 / 420
11.8iotop：動態(tài)顯示磁盤I/O統(tǒng)計信息 / 423
11.9sar：收集系統(tǒng)信息 / 425
11.10chkconfig：管理開機服務 / 430
11.11ntsysv：管理開機服務 / 433
11.12 setup：系統(tǒng)管理工具 / 434
11.13ethtool：查詢網(wǎng)卡參數(shù) / 436
11.14mii-tool：管理網(wǎng)絡接口的狀態(tài) / 437
11.19rpm：RPM包管理器 / 443
11.20yum：自動化RPM包管理工具 / 446
top命令
第12章 Linux系統(tǒng)常用內置命令 / 450
12.1Linux內置命令概述 / 450
12.2Linux內置命令簡介 / 450
12.3Linux常用內置命令實例 / 452
1、目錄切換命令
cd usr/ 切換到該目錄下usr目錄
cd ../ 切換到上一層目錄
cd /切換到系統(tǒng)根目錄
cd ~ 切換到用戶主目錄
2、目錄操作命令
（1）增加目錄
命令：mkdir 目錄名稱
（2）查看目錄
???ls [-al] 父目錄? ?ls -l 可以縮寫成ll
? ? ? （3）尋找目錄
???find 目錄 參數(shù)（重點）
???注意這里涉及權限問題，需要先切換到root目錄?su root
? ? ? ? （4）修改目錄名稱
???mv 目錄名稱 新目錄名稱
? ? ? ? （5）拷貝目錄
???cp -r 被目錄名稱 目錄拷貝的目標位置 -----r代表? ? ? ? ? ? ? ? ? ????????遞歸拷貝
???將/usr下的newTest拷貝到根目錄下的test中，使用cp -r ????????????????/usr/newTest test/rm
? ? ? ? （6）刪除目錄
???rm [-rf] 目錄
???刪除/usr下的newTest，進入/usr下使用rm -r newTest
3、文件操作命令
? ? ? ? （1）文件創(chuàng)建??touch 文件名稱 ----- 空文件
? ? ? ? （2）文件查看????cat/more/less/tail 文件
? ? ? ? （3）修改文件內容????vim 文件
??? vim 文件------進入文件-----命令模式------按i進入編? ? ? ? ? ?????????? 輯模式-----編輯文件 -------按Esc進入底行模式----- ? ?????????????????? 輸入:wq/q!
? ? ? ? （4）刪除文件
???熟記 rm -rf 文件 即可
4、壓縮文件操作命令
? ? ? ? ? ?（1）tar -zcvf 打包壓縮后的文件名 要打包壓縮的文件
???z：調用gzip壓縮命令進行壓縮
c：打包文件
v：顯示運行過程
f：指定文件名
? ? ? ? （2）?解壓壓縮包（重點）
???tar [-xvf] 壓縮文件
5、其他命令
? ? ? ? （1）顯示當前所在位置????pwd
? ? ? ? （2）搜索命令????grep 要搜索的字符串 要搜索的文件
? ? ? ? （3）管道命令 | 將前一個命令的輸出作為本次目錄的? ? ? ????????????????輸入
? ? ? ? （4）查看進程? ? ?ps -ef
? ? ? ? （5）網(wǎng)絡通信命令????查看當前系統(tǒng)的網(wǎng)卡信息：ifconfig
??查看與某臺機器的連接情況：ping
? ? ? ? （6）查看當前系統(tǒng)的端口使用?netstat –an,通常和 | ????????????????grep一起使用
6、Linux的權限命令
???在隨意某個目錄下ls -l??查看某個目錄下的文件或目錄? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 的權限 rwx 讀取權 寫入權 執(zhí)行權?
? ? ? ? ?這個字符串有10位，可以分為4段來解讀
第一段(第1位)表示是目錄還是文件，-表示是文件，d表示是目錄；
第二段(第2-4位，共3個字符串)表示文件所屬用戶對它的權限 - 屬主權限（User）；
第三段(第5-7位，共3個字符串)表示文件所屬用戶組用戶對它的權限 - 屬組權限（Group）；
第四段(第8-10位，共3個字符串)表示其他用戶對它的權限 - 其他權限（other）；
注意：①我們用3位8進制來表示文件的權限，r(read)用4標識，w(write)用2標識，x(excute)用1標識
②r–可讀，w–可寫，x–可執(zhí)行。
③每一段的三位順序不可變，如果沒有對應的權限，則使用-表示
上圖中的-rwxrw-r–可以用八進制數(shù)字764表示。
?。。。⌒薷奈募?目錄的權限的命令：chmod
chmod u=rwx,g=rw,o=r aaa.txt 或者777 代表全部權限
7、?free查看內存信息
df -h 命令用于顯示目前在 Linux 系統(tǒng)上的文件系統(tǒng)磁盤使用情況統(tǒng)計
8、top查看資源信息（CPU）
top
補充：
關機命令
reboot? 重新啟動操作系統(tǒng)
shutdown -h now 立刻關機，其中now相當于時間為0的狀態(tài)
shutdown -h 10：23
shutdown -h +10? 系統(tǒng)再過十分鐘后自動關機
Linux命令
目錄操作
? ? cd usr/? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 切換到該目錄下usr目錄
? ? cd ..? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 切換到上一層目錄
? ? cd /? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 切換到系統(tǒng)根目錄
? ? mkdir 目錄名稱? ? ? ? ? ? ? 創(chuàng)建目錄
? ? ls? ? ? 目錄名稱? ? ? ? ? ? ? ? 查詢該目錄下所有的目錄和文件
? ? ls [-a]? 目錄名稱? ? ? ? ? ? ? 查詢該目錄下所有的目錄和文件,包含隱藏文件
? ? ls [-l]? 目錄名稱? ? ? ? ? ? ? 查詢該目錄下所有的目錄和文件的詳細信息
? ? find / -name 目錄名稱? ? 查找/root下的目錄(文件)
? ? mv 目錄名稱 新目錄名稱? 修改目錄名稱
? ? mv 目錄名稱 目錄的新位置? ? ? 剪切
? ? cp -r 目錄名稱 目錄的目標位置? 拷貝
? ? rm -rf? 目錄? ? ? ? ? ? ? ? ? 強制刪除目錄
文件操作
? ? touch 文件名稱? ? ? ? ? ? 創(chuàng)建空文件
? ? cat/more/less/tail 文件? 查看文件內容
? ? tail -f 文件? ? ? ? ? ? ? ? ? 動態(tài)查看/實時查看文件(日志)
? ? grep 要搜索的字符串 要搜索的文件? ? ? ? ? ? ? ? 關鍵字搜索
? ? vi/vim? 文件? ? ? ? ? ? ? ? 修改文件內容
? ? rm -rf 文件? ? ? ? ? ? ? ? 強制刪除文件
文件的打包
? ? tar -zcvf 文件名.tar? 要打包的文件
文件的解壓?
? ? tar -xvf 文件名.tar
擴充:將文件解壓到固定位置
? ? tar -xvf 文件名.tar -C 指定解壓的位置
查詢當前所在位置
? ? pwd? ? ?
查看進程
? ? ps -ef | grep 進程名稱(tomcat/mysql)
殺死進程
? ? kill -9 進程pid
查看端口號
? ? netstat -an | grep 端口號(3306)
查看服務器ip
? ? ifconfig
查看網(wǎng)絡是否能正常使用
? ? ping 外網(wǎng)地址? ? ? ? ? ? 查看是否能訪問外網(wǎng)
? ? ping 內網(wǎng)ip? ? ? ? ? ? ? ? 查看是否能訪問內網(wǎng)
權限命令
? ? chmod 777 文件? ? ? ? 賦權
查看cpu
? ? top
查看磁盤信息
? ? df -h
查看內存信息
? ? free? ?
關機命令
? ? shutdown -h now? 立刻關機，其中now相當于時間為0的狀態(tài)
? ? shutdown -h 10：23
? ? shutdown -h +10? ? 系統(tǒng)再過十分鐘后自動關機
重新啟動
? ? reboot? ? 重新啟動操作系統(tǒng)
top命令是Linux下常用的性能分析工具，能夠實時顯示系統(tǒng)中各個進程的資源占用狀況
iostat工具將對系統(tǒng)的磁盤操作活動進行監(jiān)視。它的特點是匯報磁盤活動統(tǒng)計情況，同時也會匯報出CPU使用情況。
Netstat 命令用于顯示各種網(wǎng)絡相關信息，如網(wǎng)絡連接，路由表，接口狀態(tài) (Interface Statistics)，masquerade 連接，多播成員 (Multicast Memberships) 等等。
Linux df（英文全拼：disk free） 命令用于顯示目前在 Linux 系統(tǒng)上的文件系統(tǒng)磁盤使用情況統(tǒng)計。
find命令用來在指定目錄下查找文件。任何位于參數(shù)之前的字符串都將被視為欲查找的目錄名。如果使用該命令時，不設置任何參數(shù)，則 find 命令將在當前目錄下查找子目錄與文件。并且將查找到的子目錄和文件全部進行顯示。
crontab是用來定期執(zhí)行程序的命令。
重慶分公司
重慶分公司
