基本設(shè)計(jì)思路：
專(zhuān)注于為中小企業(yè)提供成都網(wǎng)站制作、成都做網(wǎng)站、外貿(mào)營(yíng)銷(xiāo)網(wǎng)站建設(shè)服務(wù),電腦端+手機(jī)端+微信端的三站合一,更高效的管理,為中小企業(yè)匯川免費(fèi)做網(wǎng)站提供優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。我們立足成都，凝聚了一批互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)人才，有力地推動(dòng)了上1000+企業(yè)的穩(wěn)健成長(zhǎng)，幫助中小企業(yè)通過(guò)網(wǎng)站建設(shè)實(shí)現(xiàn)規(guī)模擴(kuò)充和轉(zhuǎn)變。
類(lèi)型轉(zhuǎn)換、類(lèi)型斷言、動(dòng)態(tài)派發(fā)。iface，eface。
反射對(duì)象具有的方法：
編譯優(yōu)化：
內(nèi)部實(shí)現(xiàn)：
實(shí)現(xiàn) Context 接口有以下幾個(gè)類(lèi)型（空實(shí)現(xiàn)就忽略了）：
互斥鎖的控制邏輯：
設(shè)計(jì)思路：
（以上為寫(xiě)被讀阻塞，下面是讀被寫(xiě)阻塞）
總結(jié)，讀寫(xiě)鎖的設(shè)計(jì)還是非常巧妙的：
設(shè)計(jì)思路：
WaitGroup 有三個(gè)暴露的函數(shù):
部件：
設(shè)計(jì)思路：
結(jié)構(gòu)：
Once 只暴露了一個(gè)方法：
實(shí)現(xiàn)：
三個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)：
細(xì)節(jié)：
讓多協(xié)程任務(wù)的開(kāi)始執(zhí)行時(shí)間可控（按順序或歸一）。（Context 是控制結(jié)束時(shí)間）
設(shè)計(jì)思路： 通過(guò)一個(gè)鎖和內(nèi)置的 notifyList 隊(duì)列實(shí)現(xiàn)，Wait() 會(huì)生成票據(jù)，并將等待協(xié)程信息加入鏈表中，等待控制協(xié)程中發(fā)送信號(hào)通知一個(gè)（Signal()）或所有（Boardcast()）等待者（內(nèi)部實(shí)現(xiàn)是通過(guò)票據(jù)通知的）來(lái)控制協(xié)程解除阻塞。
暴露四個(gè)函數(shù)：
實(shí)現(xiàn)細(xì)節(jié)：
部件：
包： golang.org/x/sync/errgroup
作用：開(kāi)啟 func() error 函數(shù)簽名的協(xié)程，在同 Group 下協(xié)程并發(fā)執(zhí)行過(guò)程并收集首次 err 錯(cuò)誤。通過(guò) Context 的傳入，還可以控制在首次 err 出現(xiàn)時(shí)就終止組內(nèi)各協(xié)程。
設(shè)計(jì)思路：
結(jié)構(gòu)：
暴露的方法：
實(shí)現(xiàn)細(xì)節(jié)：
注意問(wèn)題：
包： "golang.org/x/sync/semaphore"
作用：排隊(duì)借資源（如錢(qián)，有借有還）的一種場(chǎng)景。此包相當(dāng)于對(duì)底層信號(hào)量的一種暴露。
設(shè)計(jì)思路：有一定數(shù)量的資源 Weight，每一個(gè) waiter 攜帶一個(gè) channel 和要借的數(shù)量 n。通過(guò)隊(duì)列排隊(duì)執(zhí)行借貸。
結(jié)構(gòu)：
暴露方法：
細(xì)節(jié)：
部件：
細(xì)節(jié)：
包： "golang.org/x/sync/singleflight"
作用：防擊穿。瞬時(shí)的相同請(qǐng)求只調(diào)用一次，response 被所有相同請(qǐng)求共享。
設(shè)計(jì)思路：按請(qǐng)求的 key 分組（一個(gè) *call 是一個(gè)組，用 map 映射存儲(chǔ)組），每個(gè)組只進(jìn)行一次訪問(wèn)，組內(nèi)每個(gè)協(xié)程會(huì)獲得對(duì)應(yīng)結(jié)果的一個(gè)拷貝。
結(jié)構(gòu)：
邏輯：
細(xì)節(jié)：
部件：
如有錯(cuò)誤，請(qǐng)批評(píng)指正。
ES指標(biāo)聚合，就是類(lèi)似SQL的統(tǒng)計(jì)函數(shù)，指標(biāo)聚合可以單獨(dú)使用，也可以跟桶聚合一起使用，下面介紹golang如何使用ES的指標(biāo)聚合。
不了解ES指標(biāo)聚合相關(guān)知識(shí)，先看一下 Elasticsearch 指標(biāo)聚合教程
值聚合，主要用于統(tǒng)計(jì)文檔總數(shù)，類(lèi)似SQL的count函數(shù)。
基數(shù)聚合，也是用于統(tǒng)計(jì)文檔的總數(shù)，跟Value Count的區(qū)別是，基數(shù)聚合會(huì)去重，不會(huì)統(tǒng)計(jì)重復(fù)的值，類(lèi)似SQL的count(DISTINCT 字段)用法。
求平均值
求和計(jì)算
求最大值
求最小值
package main
import (
"fmt"
"os"
)
func main() {
if len(os.Args) 2 {
fmt.Println("Please Input File Name!")
return
}
file, err := os.Open(os.Args[1])
if err != nil {
return
}
buff := make([]byte, 1000)
_, err = file.Read(buff)
if err != nil {
return
}
a, c, d, e, _ := Sum(buff)
fmt.Printf("a c d e \n%d %d %d %d\n", a, c, d, e)
}
func Sum(buff []byte) (a, c, d, e, def int) {
for i := 0; i len(buff); i++ {
switch buff[i] {
case 'a':
a++
case 'c':
c++
case 'd':
d++
case 'e':
e++
default:
def++
}
}
return
}
類(lèi)似于語(yǔ)義網(wǎng)絡(luò)。是為了生物界有一個(gè)統(tǒng)一的數(shù)據(jù)交流語(yǔ)言。 因?yàn)樵谏飳W(xué)界，存在在種種同名異義、異議同名的現(xiàn)象。為此產(chǎn)生了GO項(xiàng)目。
GO是用一套統(tǒng)一的詞匯表來(lái)描述生物學(xué)中的分子功能、生物過(guò)程和細(xì)胞成分。其思想大概過(guò)程：對(duì)于一個(gè)基因產(chǎn)品（蛋白質(zhì)或RNA），用某些詞匯來(lái)描述它是干什么的或位于細(xì)胞哪里、或者參與了哪個(gè)生物過(guò)程，而這些詞匯就是來(lái)自GO的Term。
（1）提供生物學(xué)功能（術(shù)語(yǔ)）的邏輯結(jié)構(gòu)及其相互之間的關(guān)系，表現(xiàn)為有向無(wú)環(huán)圖
（2）給特定的基因產(chǎn)物（蛋白質(zhì)，非編碼RNA或大分子復(fù)合體，簡(jiǎn)稱(chēng)為'基因'）起一個(gè)特定的名字（唯一標(biāo)識(shí)該基因）
Gene Ontology（GO）中最基本的概念是term。GO里面的每一個(gè)entry都有一個(gè)唯一的數(shù)字標(biāo)記，形如GO:nnnnnnn，還有一個(gè)term名，比如"cell", "fibroblast growth factor receptor binding"，或者"signal transduction"。每個(gè)term都屬于一個(gè)ontology，總共有三個(gè)ontology，它們分別是
細(xì)胞成分：細(xì)胞的部分或其細(xì)胞外環(huán)境;
分子功能：基因產(chǎn)物在分子水平上的元素活性，例如結(jié)合或催化;
生物過(guò)程：具有確定開(kāi)始和結(jié)束的分子事件的操作或集合，與綜合生活單元的功能有關(guān)
理由一：
在基因表達(dá)譜分析中，GO常用于提供基因功能分類(lèi)標(biāo)簽和基因功能研究的背景知識(shí)。利用GO的知識(shí)體系和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，旨在發(fā)掘與基因差異表達(dá)現(xiàn)象關(guān)聯(lián)的單個(gè)特征基因功能類(lèi)或多個(gè)特征功能類(lèi)的組合。
根據(jù)GO的知識(shí)體系，使用“功能類(lèi)”（或者叫做“功能模塊”）這一概念具有以下優(yōu)點(diǎn)：我們認(rèn)為，單個(gè)基因的表達(dá)情況的改變不足以反映特定功能/通路的整體變化情況。因?yàn)轭?lèi)似人類(lèi)社會(huì)的組織結(jié)構(gòu)，生物體的功能的實(shí)現(xiàn)決不僅僅是依靠一兩個(gè)基因功能的改變來(lái)實(shí)現(xiàn)的。因此過(guò)分著重單個(gè)基因表達(dá)變化，將會(huì)在后期結(jié)果處理中嚴(yán)重干擾對(duì)于結(jié)果的合理分析，導(dǎo)致偏倚性加大，而且是無(wú)法避免的。因此利用GO的結(jié)構(gòu)體系，把參與同樣功能/通路的基因進(jìn)行“功能類(lèi)”層面的抽象和整合，提供比基因更高一層次的抽象結(jié)論，對(duì)理解疾病的發(fā)病機(jī)制或藥物的作用機(jī)理等更有幫助。
但是該方法也存在一定的不足，由于生物體內(nèi)部的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能具有“scale-free network”的特點(diǎn)，個(gè)別功能重要的基因（主效基因）具有“Hub節(jié)點(diǎn)”的重要特性，它的功能改變可能對(duì)于整個(gè)網(wǎng)絡(luò)來(lái)說(shuō)是至關(guān)重要的，在這點(diǎn)上，這些重要的基因又具有一定的“自私獨(dú)裁”特點(diǎn)。而“功能類(lèi)”之觀點(diǎn)模糊了這種差別特性，過(guò)于強(qiáng)調(diào)“共性”，而忽視了“個(gè)性”，這也是“功能類(lèi)”的一個(gè)不足之處，這就需要結(jié)合相關(guān)的生物學(xué)知識(shí)才能夠?qū)崿F(xiàn)
理由二：
GO（gene ontology）對(duì)大家而言也許會(huì)是一個(gè)相對(duì)陌生的名詞，但是它已經(jīng)成為生物信息領(lǐng)域中一個(gè)極為重要的方法和工具，并正在逐步改變著我們對(duì) biological data的組織和理解方式，它的存在已經(jīng)大大加快了我們對(duì)所擁有的生物數(shù)據(jù)的整合和利用，我們應(yīng)該逐步學(xué)會(huì)理解和掌握這種思想和工具。
眾所周知，sequence based biology中的核心內(nèi)容即是對(duì)序列的Annotation（注釋?zhuān)?，其中主要包含structural annotation和functional annotation，前者涉及分析sequence在genome中的locus以及exon，intron，promoter等的location，而后者則是推斷序列編碼產(chǎn)物的功能
隨著多種生物genome的相繼解碼，同時(shí)大量ESTs以及gene expression profile date的積累，使得annotation的工作量和復(fù)雜度大大增加。然而另一方面，大多數(shù)基因在不同真核生物中擁有共同的主要生物功能，通過(guò)在某些物種中獲得的基因或者蛋白質(zhì)（shared protein）的生物學(xué)信息，可以用以解釋其他物種中對(duì)應(yīng)的基因或蛋白（especially in comparative genomics）。由于這些繁復(fù)的功能信息主要是包含在積累的文獻(xiàn)之中，如何有效的提取和綜合這些信息就是我們面臨的核心困難，這也是GO所要著力解決的問(wèn)題。通過(guò)建立一套具有動(dòng)態(tài)形式的控制字集（controlled vocabulary），來(lái)解釋真核基因及蛋白在細(xì)胞內(nèi)所扮演的角色，并隨著生命科學(xué)研究的進(jìn)步，不斷積累和更新。一個(gè)ontology會(huì)被一個(gè)控制字集來(lái)描述并給予一定的名稱(chēng)，通過(guò)制定“本體”ontologies并運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法及自然語(yǔ)言處理技術(shù)，可以實(shí)現(xiàn)知識(shí)管理的專(zhuān)家系統(tǒng)控制
總結(jié)：
Gene Ontology（GO）包含了基因參與的生物過(guò)程，所處的細(xì)胞位置，發(fā)揮的分子功能三方面功能信息，并將概念粗細(xì)不同的功能概念組織成DAG（有向無(wú)環(huán)圖）的結(jié)構(gòu)。
Gene Ontology是一個(gè)使用有控制的詞匯表和嚴(yán)格定義的概念關(guān)系，以有向無(wú)環(huán)圖的形式統(tǒng)一表示各物種的基因功能分類(lèi)體系，從而較全面地概括了基因的功能信息，糾正了傳統(tǒng)功能分類(lèi)體系中常見(jiàn)的維度混淆問(wèn)題。
在基因表達(dá)譜分析中，GO常用于提供基因功能分類(lèi)標(biāo)簽和基因功能研究的背景知識(shí)。利用GO的知識(shí)體系和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，旨在發(fā)掘與基因差異表達(dá)現(xiàn)象關(guān)聯(lián)的單個(gè)特征基因功能類(lèi)或多個(gè)特征功能類(lèi)的組合。
原文：
重慶分公司
重慶分公司
