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gpmgo語言 gp怎么寫

GPM是什么意思

GPM有多種釋義,包括計(jì)量單位,著名紙模型品牌等等。在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,GPM是The Global Proteome Machine的縮寫,其支持的生物信息學(xué)開源軟件項(xiàng)目X!Tandem在蛋白質(zhì)組學(xué)方面有很強(qiáng)的應(yīng)用性。

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另外,“GPM”也可解釋為“良好的生產(chǎn)規(guī)范”,是藥品、食品等行業(yè)強(qiáng)制執(zhí)行的標(biāo)準(zhǔn),是在生產(chǎn)過程中對產(chǎn)品質(zhì)量及衛(wèi)生安全實(shí)施自主管理的制度。

擴(kuò)展資料

GPM (Global Proteome Machine)系統(tǒng)由GPMO(The Global Proteome Machine Organization)支持建立。

它的建立使應(yīng)用串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究的科學(xué)家,能夠使用GPM數(shù)據(jù)信息來分析蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)。此平臺由 GPMO提供并通過支持的項(xiàng)目來改善數(shù)據(jù)分析的質(zhì)量,通過不斷的測試和驗(yàn)證蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果,從而推進(jìn)分析結(jié)果的便捷可靠。

GPM可針對不同類型的質(zhì)譜注釋信息,及時(shí)整合到分析平臺中,供相關(guān)的研究人員使用。平臺已整合了GO(Gene Ontology)、ENSEMBL等的數(shù)據(jù)注釋。

【golang詳解】go語言GMP(GPM)原理和調(diào)度

Goroutine調(diào)度是一個(gè)很復(fù)雜的機(jī)制,下面嘗試用簡單的語言描述一下Goroutine調(diào)度機(jī)制,想要對其有更深入的了解可以去研讀一下源碼。

首先介紹一下GMP什么意思:

G ----------- goroutine: 即Go協(xié)程,每個(gè)go關(guān)鍵字都會創(chuàng)建一個(gè)協(xié)程。

M ---------- thread內(nèi)核級線程,所有的G都要放在M上才能運(yùn)行。

P ----------- processor處理器,調(diào)度G到M上,其維護(hù)了一個(gè)隊(duì)列,存儲了所有需要它來調(diào)度的G。

Goroutine 調(diào)度器P和 OS 調(diào)度器是通過 M 結(jié)合起來的,每個(gè) M 都代表了 1 個(gè)內(nèi)核線程,OS 調(diào)度器負(fù)責(zé)把內(nèi)核線程分配到 CPU 的核上執(zhí)行

模型圖:

避免頻繁的創(chuàng)建、銷毀線程,而是對線程的復(fù)用。

1)work stealing機(jī)制

當(dāng)本線程無可運(yùn)行的G時(shí),嘗試從其他線程綁定的P偷取G,而不是銷毀線程。

2)hand off機(jī)制

當(dāng)本線程M0因?yàn)镚0進(jìn)行系統(tǒng)調(diào)用阻塞時(shí),線程釋放綁定的P,把P轉(zhuǎn)移給其他空閑的線程執(zhí)行。進(jìn)而某個(gè)空閑的M1獲取P,繼續(xù)執(zhí)行P隊(duì)列中剩下的G。而M0由于陷入系統(tǒng)調(diào)用而進(jìn)被阻塞,M1接替M0的工作,只要P不空閑,就可以保證充分利用CPU。M1的來源有可能是M的緩存池,也可能是新建的。當(dāng)G0系統(tǒng)調(diào)用結(jié)束后,根據(jù)M0是否能獲取到P,將會將G0做不同的處理:

如果有空閑的P,則獲取一個(gè)P,繼續(xù)執(zhí)行G0。

如果沒有空閑的P,則將G0放入全局隊(duì)列,等待被其他的P調(diào)度。然后M0將進(jìn)入緩存池睡眠。

如下圖

GOMAXPROCS設(shè)置P的數(shù)量,最多有GOMAXPROCS個(gè)線程分布在多個(gè)CPU上同時(shí)運(yùn)行

在Go中一個(gè)goroutine最多占用CPU 10ms,防止其他goroutine被餓死。

具體可以去看另一篇文章

【Golang詳解】go語言調(diào)度機(jī)制 搶占式調(diào)度

當(dāng)創(chuàng)建一個(gè)新的G之后優(yōu)先加入本地隊(duì)列,如果本地隊(duì)列滿了,會將本地隊(duì)列的G移動到全局隊(duì)列里面,當(dāng)M執(zhí)行work stealing從其他P偷不到G時(shí),它可以從全局G隊(duì)列獲取G。

協(xié)程經(jīng)歷過程

我們創(chuàng)建一個(gè)協(xié)程 go func()經(jīng)歷過程如下圖:

說明:

這里有兩個(gè)存儲G的隊(duì)列,一個(gè)是局部調(diào)度器P的本地隊(duì)列、一個(gè)是全局G隊(duì)列。新創(chuàng)建的G會先保存在P的本地隊(duì)列中,如果P的本地隊(duì)列已經(jīng)滿了就會保存在全局的隊(duì)列中;處理器本地隊(duì)列是一個(gè)使用數(shù)組構(gòu)成的環(huán)形鏈表,它最多可以存儲 256 個(gè)待執(zhí)行任務(wù)。

G只能運(yùn)行在M中,一個(gè)M必須持有一個(gè)P,M與P是1:1的關(guān)系。M會從P的本地隊(duì)列彈出一個(gè)可執(zhí)行狀態(tài)的G來執(zhí)行,如果P的本地隊(duì)列為空,就會想其他的MP組合偷取一個(gè)可執(zhí)行的G來執(zhí)行;

一個(gè)M調(diào)度G執(zhí)行的過程是一個(gè)循環(huán)機(jī)制;會一直從本地隊(duì)列或全局隊(duì)列中獲取G

上面說到P的個(gè)數(shù)默認(rèn)等于CPU核數(shù),每個(gè)M必須持有一個(gè)P才可以執(zhí)行G,一般情況下M的個(gè)數(shù)會略大于P的個(gè)數(shù),這多出來的M將會在G產(chǎn)生系統(tǒng)調(diào)用時(shí)發(fā)揮作用。類似線程池,Go也提供一個(gè)M的池子,需要時(shí)從池子中獲取,用完放回池子,不夠用時(shí)就再創(chuàng)建一個(gè)。

work-stealing調(diào)度算法:當(dāng)M執(zhí)行完了當(dāng)前P的本地隊(duì)列隊(duì)列里的所有G后,P也不會就這么在那躺尸啥都不干,它會先嘗試從全局隊(duì)列隊(duì)列尋找G來執(zhí)行,如果全局隊(duì)列為空,它會隨機(jī)挑選另外一個(gè)P,從它的隊(duì)列里中拿走一半的G到自己的隊(duì)列中執(zhí)行。

如果一切正常,調(diào)度器會以上述的那種方式順暢地運(yùn)行,但這個(gè)世界沒這么美好,總有意外發(fā)生,以下分析goroutine在兩種例外情況下的行為。

Go runtime會在下面的goroutine被阻塞的情況下運(yùn)行另外一個(gè)goroutine:

用戶態(tài)阻塞/喚醒

當(dāng)goroutine因?yàn)閏hannel操作或者network I/O而阻塞時(shí)(實(shí)際上golang已經(jīng)用netpoller實(shí)現(xiàn)了goroutine網(wǎng)絡(luò)I/O阻塞不會導(dǎo)致M被阻塞,僅阻塞G,這里僅僅是舉個(gè)栗子),對應(yīng)的G會被放置到某個(gè)wait隊(duì)列(如channel的waitq),該G的狀態(tài)由_Gruning變?yōu)開Gwaitting,而M會跳過該G嘗試獲取并執(zhí)行下一個(gè)G,如果此時(shí)沒有可運(yùn)行的G供M運(yùn)行,那么M將解綁P,并進(jìn)入sleep狀態(tài);當(dāng)阻塞的G被另一端的G2喚醒時(shí)(比如channel的可讀/寫通知),G被標(biāo)記為,嘗試加入G2所在P的runnext(runnext是線程下一個(gè)需要執(zhí)行的 Goroutine。), 然后再是P的本地隊(duì)列和全局隊(duì)列。

系統(tǒng)調(diào)用阻塞

當(dāng)M執(zhí)行某一個(gè)G時(shí)候如果發(fā)生了阻塞操作,M會阻塞,如果當(dāng)前有一些G在執(zhí)行,調(diào)度器會把這個(gè)線程M從P中摘除,然后再創(chuàng)建一個(gè)新的操作系統(tǒng)的線程(如果有空閑的線程可用就復(fù)用空閑線程)來服務(wù)于這個(gè)P。當(dāng)M系統(tǒng)調(diào)用結(jié)束時(shí)候,這個(gè)G會嘗試獲取一個(gè)空閑的P執(zhí)行,并放入到這個(gè)P的本地隊(duì)列。如果獲取不到P,那么這個(gè)線程M變成休眠狀態(tài), 加入到空閑線程中,然后這個(gè)G會被放入全局隊(duì)列中。

隊(duì)列輪轉(zhuǎn)

可見每個(gè)P維護(hù)著一個(gè)包含G的隊(duì)列,不考慮G進(jìn)入系統(tǒng)調(diào)用或IO操作的情況下,P周期性的將G調(diào)度到M中執(zhí)行,執(zhí)行一小段時(shí)間,將上下文保存下來,然后將G放到隊(duì)列尾部,然后從隊(duì)列中重新取出一個(gè)G進(jìn)行調(diào)度。

除了每個(gè)P維護(hù)的G隊(duì)列以外,還有一個(gè)全局的隊(duì)列,每個(gè)P會周期性地查看全局隊(duì)列中是否有G待運(yùn)行并將其調(diào)度到M中執(zhí)行,全局隊(duì)列中G的來源,主要有從系統(tǒng)調(diào)用中恢復(fù)的G。之所以P會周期性地查看全局隊(duì)列,也是為了防止全局隊(duì)列中的G被餓死。

除了每個(gè)P維護(hù)的G隊(duì)列以外,還有一個(gè)全局的隊(duì)列,每個(gè)P會周期性地查看全局隊(duì)列中是否有G待運(yùn)行并將其調(diào)度到M中執(zhí)行,全局隊(duì)列中G的來源,主要有從系統(tǒng)調(diào)用中恢復(fù)的G。之所以P會周期性地查看全局隊(duì)列,也是為了防止全局隊(duì)列中的G被餓死。

M0

M0是啟動程序后的編號為0的主線程,這個(gè)M對應(yīng)的實(shí)例會在全局變量rutime.m0中,不需要在heap上分配,M0負(fù)責(zé)執(zhí)行初始化操作和啟動第一個(gè)G,在之后M0就和其他的M一樣了

G0

G0是每次啟動一個(gè)M都會第一個(gè)創(chuàng)建的goroutine,G0僅用于負(fù)責(zé)調(diào)度G,G0不指向任何可執(zhí)行的函數(shù),每個(gè)M都會有一個(gè)自己的G0,在調(diào)度或系統(tǒng)調(diào)用時(shí)會使用G0的??臻g,全局變量的G0是M0的G0

一個(gè)G由于調(diào)度被中斷,此后如何恢復(fù)?

中斷的時(shí)候?qū)⒓拇嫫骼锏臈P畔?,保存到自己的G對象里面。當(dāng)再次輪到自己執(zhí)行時(shí),將自己保存的棧信息復(fù)制到寄存器里面,這樣就接著上次之后運(yùn)行了。

我這里只是根據(jù)自己的理解進(jìn)行了簡單的介紹,想要詳細(xì)了解有關(guān)GMP的底層原理可以去看Go調(diào)度器 G-P-M 模型的設(shè)計(jì)者的文檔或直接看源碼

參考: ()

()

GPM是什么意思呢?

有多種釋義,包括計(jì)量單位,著名紙模型品牌等等。在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,GPM是The Global Proteome Machine的縮寫,其支持的生物信息學(xué)開源軟件項(xiàng)目X!Tandem在蛋白質(zhì)組學(xué)方面有很強(qiáng)的應(yīng)用性。

另外,“GPM”也可解釋為“良好的生產(chǎn)規(guī)范”,是藥品、食品等行業(yè)強(qiáng)制執(zhí)行的標(biāo)準(zhǔn),是在生產(chǎn)過程中對產(chǎn)品質(zhì)量及衛(wèi)生安全實(shí)施自主管理的制度。

擴(kuò)展資料

G、P、M 是 Go 調(diào)度器的三個(gè)核心組件,各司其職。在它們精密地配合下,Go 調(diào)度器得以高效運(yùn)轉(zhuǎn),這也是 Go 天然支持高并發(fā)的內(nèi)在動力。今天這篇文章我們來深入理解 GPM 模型。

先看 G,取 goroutine 的首字母,主要保存 goroutine 的一些狀態(tài)信息以及 CPU 的一些寄存器的值,例如 IP 寄存器,以便在輪到本 goroutine 執(zhí)行時(shí),CPU 知道要從哪一條指令處開始執(zhí)行。

當(dāng) goroutine 被調(diào)離 CPU 時(shí),調(diào)度器負(fù)責(zé)把 CPU 寄存器的值保存在 g 對象的成員變量之中。

當(dāng) goroutine 被調(diào)度起來運(yùn)行時(shí),調(diào)度器又負(fù)責(zé)把 g 對象的成員變量所保存的寄存器值恢復(fù)到 CPU 的寄存器。

參考資料來源:百度百科-gpm

2020-08-20:GO語言中的協(xié)程與Python中的協(xié)程的區(qū)別?

福哥答案2020-08-20:

1.golang的協(xié)程是基于gpm機(jī)制,是可以多核多線程的。Python的協(xié)程是eventloop模型(IO多路復(fù)用技術(shù))實(shí)現(xiàn),協(xié)程是嚴(yán)格的 1:N 關(guān)系,也就是一個(gè)線程對應(yīng)了多個(gè)協(xié)程。雖然可以實(shí)現(xiàn)異步I/O,但是不能有效利用多核(GIL)。

2.golang用go func。python用import asyncio,async/await表達(dá)式。

評論

Go語言有什么好用的IDE嗎

我喜歡jetbrains系列的IDE+go插件。不過我要說的是這個(gè)問題主要看你的觀點(diǎn)如何。

說eclipse:

構(gòu)建方式是使用go install 命令,每一次編譯運(yùn)行都是go install。這樣的好處就是如果你有很多的包,下載下來并沒有編譯,這樣每次編譯速度是很快的。而且(?。ゞo install 符合go官方的項(xiàng)目結(jié)構(gòu),官方說過了,一個(gè)go的項(xiàng)目應(yīng)該是以個(gè)gopath,包含src,pkg,bin三個(gè)主要目錄。所以說go install個(gè)人認(rèn)為才是主要的go編譯方式。

說eclipse的缺點(diǎn):

其實(shí)eclipse插件的go編譯方式,還有目錄結(jié)構(gòu),項(xiàng)目結(jié)構(gòu),都是非常完美的?。。?!真的很完美!可是,他的代碼提示,太差件!大括號都不能自動補(bǔ)全,gdb 32bit 64bit兼容問題,eclipseC++ 沒有html js插件,需要手動安裝,幾乎不能開箱即用。不過如果你是開發(fā)算法,數(shù)據(jù)處理,還是推薦eclipse的,畢竟其他都無關(guān)緊要。

說jetbrains:

說先說clione肯定不適合,新建項(xiàng)目沒有向?qū)?,?dǎo)致改成go項(xiàng)目各種不開心,比如圖標(biāo)對于我來說就無法接受go lib 不是小耗子~這是次要的,重要的是各個(gè)文件都是灰色的(沒有在cmake中包含的結(jié)果),然后說剩下的,phpstorm這個(gè)不說了,估計(jì)很少有人插件按在這里,webstorm,體驗(yàn)也不是很好,idea?體驗(yàn)很好,可是畢竟比較重,尤其是現(xiàn)在加入了自家的K啥玩意(無意冒犯,沒記住單詞)~可是話說回來,go跟C系列IDE配合才是最佳,跟java系列一點(diǎn)不搭關(guān)系,用idea似乎有點(diǎn)格格不入,但是!idea支持新建項(xiàng)目向?qū)?,lib的圖標(biāo)也很清晰,最后還是選擇idea吧,期待clion的強(qiáng)大起來!

再說jetbrains系列缺點(diǎn):

插件的構(gòu)建方式是go buiild 這個(gè)讓人很不爽,我們幾乎不確定會構(gòu)建到什么地方去,還要每次設(shè)置一下run配置。這個(gè)可能無關(guān)緊要,畢竟不是什么大的毛病,可是go build不能緩存.a文件,直接構(gòu)建的結(jié)果就是很多第三方包的情況下很慢!所以建議安裝包的時(shí)候手動install 一下解決這個(gè)問題。自帶代碼格式化,這個(gè)格式化跟go 格格不入,總的來說就是蛋疼,心碎,菊花癢。

最后說liteIDE:

輕量級IDE,我可以說是國人GO偉大作品典范,然而默認(rèn)構(gòu)建也是go build,項(xiàng)目管理方式不符合go官方標(biāo)準(zhǔn)。代碼提示不能自動導(dǎo)入(eclipse也不能),不過如果你的項(xiàng)目是以包為單位的,那么另當(dāng)別論。一定很不錯(cuò),畢竟是輕量級專門針對GO的IDE!

說這些,其實(shí)還有很大一部分取決于你的項(xiàng)目是用vendor機(jī)制管理,還是godeps機(jī)制管理依賴關(guān)系。go不像java擁有強(qiáng)大的幾乎天下一統(tǒng)的maven(無意冒犯,暫不評價(jià)其他構(gòu)建套件)。

go沒有官方包倉庫。

go沒有官方包管理工具。

go沒有官方自動化構(gòu)建套件。

上面三個(gè)沒有是致命要害。導(dǎo)致民間各種百花齊放。

說說我的項(xiàng)目怎么管理

gpm 一個(gè)shell工具(windows下你可以用git的bash,或者cygwin~)

我是嚴(yán)格艷照官方推薦方式管理go項(xiàng)目,一個(gè)go項(xiàng)目一個(gè)gopath。系統(tǒng)的gopath只是為了安裝go命令,我沒有配置gobin,意義不大。

項(xiàng)目的依賴跟我的代碼包都在src下(非vendor)

vendor用來存放包的特殊依賴,發(fā)布項(xiàng)目直接把依賴包發(fā)布上去(公網(wǎng)管理則只上傳依賴關(guān)系文件 godeps文件)

資源文件等都放在src目錄同級,編譯文件放在bin,引用直接../引用。


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