Linux文本操作常用命令

在Linux系統(tǒng)里常用于文本查看、操作、統(tǒng)計(jì)的命令：

專注于為中小企業(yè)提供成都網(wǎng)站建設(shè)、網(wǎng)站建設(shè)服務(wù),電腦端+手機(jī)端+微信端的三站合一,更高效的管理,為中小企業(yè)龍里免費(fèi)做網(wǎng)站提供優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。我們立足成都，凝聚了一批互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)人才，有力地推動(dòng)了千余家企業(yè)的穩(wěn)健成長(zhǎng)，幫助中小企業(yè)通過(guò)網(wǎng)站建設(shè)實(shí)現(xiàn)規(guī)模擴(kuò)充和轉(zhuǎn)變。

通過(guò)多敲鍵盤(pán)，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每個(gè)命令的詳細(xì)的介紹（主要是跟著 生信技能樹(shù)小郭老師 學(xué)習(xí)做的筆記）

接下來(lái)通過(guò)示例把10個(gè)命令的常用參數(shù)和用法展示出來(lái)：

參數(shù)的用法介紹：

注意事項(xiàng)：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 符號(hào)，退出時(shí)，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看

結(jié)合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默認(rèn) 10 行 （在R語(yǔ)言里head和tail默認(rèn)是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比較少

3.1 less命令

less [參數(shù)] 文件名

less命令重要的補(bǔ)充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵

less命令重要的補(bǔ)充用法2 ：

參數(shù)用法：

less命令 不加參數(shù) 查看文件：

less命令加 -N參數(shù) 查看文件：顯示行號(hào)

less命令加 -S參數(shù) 查看文件：?jiǎn)涡酗@示，非常規(guī)整

對(duì)比：less和cat命令顯示文本行號(hào)的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐頁(yè)查看，按空格翻頁(yè)，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握l(shuí)ess命令就好

查看壓縮文件

wc 統(tǒng)計(jì)字符是也把換行符統(tǒng)計(jì)進(jìn)去，但是別的命令不一定會(huì)把換行符算進(jìn)去，。

常見(jiàn)參數(shù):

切記：用less命令，按q退出

cut命令是按關(guān)鍵詞來(lái)切的

常見(jiàn)參數(shù):

排列前：

排列后：

解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一個(gè)表格結(jié)構(gòu)時(shí)，因?yàn)橹票矸麑?duì)齊的原因，出現(xiàn)一個(gè)錯(cuò)位的現(xiàn)象。還有 字典排序 可能和我們平時(shí)的認(rèn)知不一樣，所以 加上-n參數(shù) ， 讓數(shù)值有數(shù)學(xué)意義上的大小來(lái)排序 。

uniq命令去重，只有兩行出現(xiàn)重復(fù)，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現(xiàn)兩行一模一樣，不會(huì)去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

換其它文件試試

總之，uniq命令使用時(shí)經(jīng)常和sort一起

常見(jiàn)參數(shù):

常見(jiàn)用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常見(jiàn)用法2 : paste - -

常見(jiàn)參數(shù):

要養(yǎng)成一個(gè)好習(xí)慣，原始數(shù)據(jù)不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符傳遞給 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的內(nèi)容

3. 在第2步的基礎(chǔ)上截取分號(hào)分割的第1列

4. 在第3步的基礎(chǔ)上排序、去重復(fù)并統(tǒng)計(jì)

5. 在第4步的基礎(chǔ)上，將空格替換成制表符

補(bǔ)充小知識(shí) ：

清屏 ：control L

查看歷史（輸入過(guò)的）命令 ：history

linux編輯文件命令

linux編輯文件命令有如下：

1、cp命令，作用復(fù)制，參數(shù)如下：

-a：將文件的特性一起復(fù)制。

-p：連同文件的屬性一起復(fù)制，而非使用默認(rèn)方式，與-a相似，常用于備份。

-i：若目標(biāo)文件已經(jīng)存在時(shí)，在覆蓋時(shí)會(huì)先詢問(wèn)操作的進(jìn)行。

-r：遞歸持續(xù)復(fù)制，用于目錄的復(fù)制行為。

-u：目標(biāo)文件與源文件有差異時(shí)才會(huì)復(fù)制。

2、rm命令作用為刪除，參數(shù)：

-f：就是force的意思，忽略不存在的文件，不會(huì)出現(xiàn)警告消息。

-i：互動(dòng)模式，在刪除前會(huì)詢問(wèn)用戶是否操作。

-r：遞歸刪除，最常用于目錄刪除，它是一個(gè)非常危險(xiǎn)的參數(shù)。

3、mv命令作用為移動(dòng)文件：

-f：force強(qiáng)制的意思，如果目標(biāo)文件已經(jīng)存在，不會(huì)詢問(wèn)而直接覆蓋。

-i：若目標(biāo)文件已經(jīng)存在，就會(huì)詢問(wèn)是否覆蓋。

-u：若目標(biāo)文件已經(jīng)存在，且比目標(biāo)文件新，才會(huì)更新。

4、pwd命令，作用為查看”當(dāng)前工作目錄“的完整路徑。

pwd-P#顯示出實(shí)際路徑，而非使用連接（link）路徑；pwd顯示的是連接路徑。

5、rmdir命令刪除目錄：

rmdir [選項(xiàng)]... 目錄...

-p：遞歸刪除目錄dirname，當(dāng)子目錄刪除后其父目錄為空時(shí)，也一同被刪除。如果整個(gè)路徑被刪除或者由于某種原因保留部分路徑，則系統(tǒng)在標(biāo)準(zhǔn)輸出上顯示相應(yīng)的信息。

-v：verbose顯示指令執(zhí)行過(guò)程。

linux--5、文本文件編輯命令

cat命令用于查看純文本文件(較短的)：

$ cat [選項(xiàng)] 文件

以下是cat命令常用的3個(gè)選項(xiàng)：

(1) $ cat -n 文件

-n 表示顯示行號(hào)。

(2) $ cat -b 文件

-b 表示顯示行號(hào)，但是不包括空行。

(3) $ cat -A 文件

-A 表示顯示出不可見(jiàn)的符號(hào)，如空格、tab鍵等。

more命令用于查看純文本文件(較長(zhǎng)的)：

$ more [選項(xiàng)] 文件

more命令常用的一個(gè)參數(shù)是"- 數(shù)字"，表示預(yù)先顯示的行數(shù)，默認(rèn)是一頁(yè)：

$ more -10 文件

head命令用于查看純文本文檔的前N行：

$ head [選項(xiàng)] 文件

(1) $ head -n 10 文件

這個(gè)命令表示顯示文件的前10行。

(2) $ head -n -10 文件

這個(gè)命令表示正常輸出，但是不顯示最后的10行。

tail命令用于查看純文本文檔的后N行：

$ tail [選項(xiàng)] [文件]

例如，顯示文件/etc/passwd的后10行：

$ tail -n 10 /etc/passwd

wc命令用于統(tǒng)計(jì)指定文本的行數(shù)、字?jǐn)?shù)、字節(jié)數(shù)：

$ wc [參數(shù)] 文本

(1) $ wc -l 文本

-l 參數(shù)表示只顯示行數(shù)。

(2) $ wc -w 文本

-w 參數(shù)表示只顯示單詞數(shù)。

(3) $ wc -c 文本

-c 參數(shù)表示只顯示字節(jié)數(shù)。