golangci-line 工具介紹

在 ci 過程中，經(jīng)常有一些可以通過靜態(tài)分析或者白盒檢測(cè)去避免一些問題以及規(guī)范代碼格式！使用Go語言一般是使用 golangci-line 作為代碼檢測(cè)工具！

10年積累的網(wǎng)站建設(shè)、網(wǎng)站設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)，可以快速應(yīng)對(duì)客戶對(duì)網(wǎng)站的新想法和需求。提供各種問題對(duì)應(yīng)的解決方案。讓選擇我們的客戶得到更好、更有力的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。我雖然不認(rèn)識(shí)你，你也不認(rèn)識(shí)我。但先制作網(wǎng)站后付款的網(wǎng)站建設(shè)流程，更有福貢免費(fèi)網(wǎng)站建設(shè)讓你可以放心的選擇與我們合作。

參考官網(wǎng)：

安裝： curl-sSfL | sh -s -- -b $(go env GOPATH)/bin v1.43.0

版本信息: golangci-lint--version

目前我司是自己二開的 golangci-line，所以這里使用的開源版本，其實(shí)大同小異，就是開發(fā)了一些插件！

這個(gè)就是一個(gè)工具，集成了各類自動(dòng)檢測(cè)代碼的工具，所以不需要本地安裝太多的工具，只需要這個(gè)工具即可！

由于它需要一個(gè)go的項(xiàng)目，這里以我自己的項(xiàng)目去介紹， 項(xiàng)目地址：，如果有同學(xué)想自己嘗試下可以直接下載我這個(gè)項(xiàng)目！項(xiàng)目也比較規(guī)范！

其實(shí)執(zhí)行 golangci-lint run-h 就可以獲取以下幫助

例如我經(jīng)常使用的: 我日常就是開啟format功能！

1、默認(rèn)使用的插件

2、默認(rèn)沒用的

3、presets 分類：

具體可以參考我的:

主要是做一些 無用代碼檢測(cè)，簡(jiǎn)化代碼，格式化代碼！然后執(zhí)行 golangci-lint run --fix 即可

轉(zhuǎn)錄組不求人系列(十三): GO、KEGG富集個(gè)性化作圖

當(dāng)富集分析完成，拿到如下的分析結(jié)果后，就可以進(jìn)行作圖了。

富集分析結(jié)果的可視化無非就是柱狀圖和氣泡圖，但是公司默認(rèn)出圖實(shí)在是太丑，所以還是自己動(dòng)手修改修改。

一、常規(guī)柱狀圖（ggplot2）

橫軸為gene counts，或者用-logP也行，填充相應(yīng)的用P值或者gene counts。ggplot畫圖的好處就是可以進(jìn)行很多調(diào)整。

二、常規(guī)氣泡圖（ggplot2）

氣泡圖與柱狀圖如出一轍，只是在展示方式上出現(xiàn)了差別。一個(gè)用geom_bar()函數(shù)，氣泡圖類似于散點(diǎn)圖用geom_point()函數(shù)。

三、上下調(diào)同時(shí)展示（ggplot2）

很多時(shí)候研究者拿到差異基因后，上下調(diào)基因是分別富集的，在展示上需要同時(shí)體現(xiàn)二者，我們之前提到metascape可以做到： 轉(zhuǎn)錄組不求人系列(十二): Cell文章最喜歡用的差異基因GO、KEGG富集分析工具 ，除此之外，之前講過的氣泡圖也可以展現(xiàn)多組的結(jié)果： 復(fù)現(xiàn)《nature communications》圖表（四）：ggplot畫多組富集氣泡圖 。這里我們繼續(xù)提供一種bar圖的展示方式。將down的數(shù)值調(diào)整為負(fù)，做一列分組，就可以展示了。

當(dāng)然了，以上所說的可視化還是比較常規(guī)，在基礎(chǔ)上可以自己做調(diào)整。也有一些文章總是標(biāo)新立意，有很多奇特的展現(xiàn)方式，我們會(huì)在之后的系列中講解。

Grafana的介紹與使用

Grafana是一款用Go語言開發(fā)的開源數(shù)據(jù)可視化工具，可以做數(shù)據(jù)監(jiān)控和數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，帶有告警功能。目前使用grafana的公司有很多，如paypal、ebay、intel等。

①可視化：快速和靈活的客戶端圖形具有多種選項(xiàng)。面板插件為許多不同的方式可視化指標(biāo)和日志。

②報(bào)警：可視化地為最重要的指標(biāo)定義警報(bào)規(guī)則。Grafana將持續(xù)評(píng)估它們，并發(fā)送通知。

③通知：警報(bào)更改狀態(tài)時(shí)，它會(huì)發(fā)出通知。接收電子郵件通知。

④動(dòng)態(tài)儀表盤：使用模板變量創(chuàng)建動(dòng)態(tài)和可重用的儀表板，這些模板變量作為下拉菜單出現(xiàn)在儀表板頂部。

⑤混合數(shù)據(jù)源：在同一個(gè)圖中混合不同的數(shù)據(jù)源!可以根據(jù)每個(gè)查詢指定數(shù)據(jù)源。這甚至適用于自定義數(shù)據(jù)源。

⑥注釋：注釋來自不同數(shù)據(jù)源圖表。將鼠標(biāo)懸停在事件上可以顯示完整的事件元數(shù)據(jù)和標(biāo)記。

⑦過濾器：過濾器允許您動(dòng)態(tài)創(chuàng)建新的鍵/值過濾器，這些過濾器將自動(dòng)應(yīng)用于使用該數(shù)據(jù)源的所有查詢。

Dashboard的建立都是基于某一個(gè)數(shù)據(jù)源的，所以要先加一個(gè)數(shù)據(jù)源。

可視化方式有很多種，不過Graph、Table、Pie chart 這三種基本就已經(jīng)滿足數(shù)據(jù)展現(xiàn)要求了。

把這個(gè)Graph折線圖Copy一份，改一下展現(xiàn)方式即可。

注意：默認(rèn)添加完table后，如果有數(shù)字，會(huì)以K為單位，比如將300000展示位30k。

數(shù)字展示方式修改，Add column style：

當(dāng)表格中出現(xiàn)數(shù)據(jù)后，需要通過篩選條件進(jìn)行篩選，grafana提供了模板變量用于自定義篩選字段。

Type:定義變量類型

Query:這個(gè)變量類型允許您編寫一個(gè)數(shù)據(jù)源查詢，該查詢通常返回一個(gè) metric names, tag values or keys。例如，返回erver names, sensor ids or data centers列表的查詢。

interval:interval值。這個(gè)變量可以代表時(shí)間跨度。不要按時(shí)間或日期直方圖間隔硬編碼一個(gè)組，使用這種類型的變量。

Datasource:此類型允許您快速更改整個(gè)儀表板的數(shù)據(jù)源。如果在不同環(huán)境中有多個(gè)數(shù)據(jù)源實(shí)例，則非常有用。

Custom:使用逗號(hào)分隔列表手動(dòng)定義變量選項(xiàng)。

Constant:定義一個(gè)隱藏常數(shù)。有用的metric路徑前綴的dashboards，你想分享。在dashboard export,期間，常量變量將作為一個(gè)重要的選項(xiàng)。

Ad hoc filters:非常特殊類型的變量，只對(duì)某些數(shù)據(jù)源，InfluxDB及Elasticsearch目前。它允許您添加將自動(dòng)添加到使用指定數(shù)據(jù)源的所有metric查詢的key/value 過濾器。

上面的Table和Graph分別使用了interval和query來定義變量進(jìn)行篩選，不再重復(fù)。

grafana只有g(shù)raph支持告警通知。

grafana的告警通知渠道有很多種，像Email、Teams、釘釘?shù)榷加兄С帧?/p>

在grafana.ini中開啟告警：

要能發(fā)送郵件通知，首先需要在配置文件grafana.ini中配置郵件服務(wù)器等信息：

Grafana是個(gè)功能強(qiáng)大、展現(xiàn)層很漂亮的數(shù)據(jù)可視化監(jiān)控工具，本篇主要介紹了Grafana基于MySQL數(shù)據(jù)源的安裝及常用姿勢(shì)，也支持其他數(shù)據(jù)源如ElasticSearch、InfluxDB等。更多內(nèi)容可看 官網(wǎng)