R語(yǔ)言ggplot2 箱線圖表示中位數(shù)的那個(gè)橫線的顏色如何設(shè)置？

1：點(diǎn)擊工具欄下的”自定義形狀工具“

創(chuàng)新互聯(lián)致力于成都網(wǎng)站設(shè)計(jì)、網(wǎng)站建設(shè)、外貿(mào)網(wǎng)站建設(shè),成都網(wǎng)站設(shè)計(jì),集團(tuán)網(wǎng)站建設(shè)等服務(wù)標(biāo)準(zhǔn)化，推過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化降低中小企業(yè)的建站的成本，并持續(xù)提升建站的定制化服務(wù)水平進(jìn)行質(zhì)量交付，讓企業(yè)網(wǎng)站從市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)中脫穎而出。 選擇創(chuàng)新互聯(lián)，就選擇了安全、穩(wěn)定、美觀的網(wǎng)站建設(shè)服務(wù)！

2：選擇自定義的”形狀“中選擇自己需要的形狀樣式

3：直接在圖層上進(jìn)行繪畫即可。

[R語(yǔ)言] GO富集分析可視化 GOplot::GOCircle

查看GOplot內(nèi)示例數(shù)據(jù)的格式，對(duì)自己的數(shù)據(jù)做處理

觀察結(jié)論：

觀察自己的兩個(gè)數(shù)據(jù)表：

table.legend 設(shè)置為T時(shí)會(huì)顯示表格

本圖中表格和圖例是出圖后剪切拼合而成，沒有用R中的拼圖包

R語(yǔ)言（ggplot）如何繪制分組比較的箱線圖？如下圖所示

boxplot(x1~name,da,at=c(1,5,9),names=paste(c('A','B','C'),'x1',sep='.'),xlim=c(0,12))

boxplot(x2~name,da,at=c(2,6,10),add=T,names=paste(c('A','B','C'),'x2',sep='.'))

boxplot(x3~name,da,at=c(3,7,11),add=T,names=paste(c('A','B','C'),'x3',sep='.'))

【R語(yǔ)言】解決GO富集分析繪圖，標(biāo)簽重疊問(wèn)題

前面我給大家詳細(xì)介紹過(guò)

?GO簡(jiǎn)介及GO富集結(jié)果解讀

?四種GO富集柱形圖、氣泡圖解讀

?GO富集分析四種風(fēng)格展示結(jié)果—柱形圖，氣泡圖

?KEGG富集分析—柱形圖，氣泡圖，通路圖

? DAVID GO和KEGG富集分析及結(jié)果可視化

也用視頻給大家介紹過(guò)

? GO和KEGG富集分析視頻講解

最近有粉絲反映說(shuō)，利用clusterProfiler這個(gè)包繪制GO富集分析氣泡圖和柱形圖的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)GO條目的名字都重疊在一起了。

氣泡圖

柱形圖

這個(gè)圖別說(shuō)美觀了，簡(jiǎn)直不忍直視。經(jīng)過(guò)我的認(rèn)真研究，發(fā)現(xiàn)跟R版本有關(guān)。前面我給大家展示的基本都是R 3.6.3做出來(lái)的圖。很多粉絲可能用的都是最新版本的R 4.1.2。

我們知道R的版本在不停的更新，相應(yīng)的R包也在不停的更新。我把繪制氣泡圖和柱形圖相關(guān)的函數(shù)拿出來(lái)認(rèn)真的研究了一下，終于發(fā)現(xiàn)的癥結(jié)所在。

dotplot這個(gè)函數(shù)，多了個(gè) label_format 參數(shù)

我們來(lái)看看這個(gè)參數(shù)究竟是干什么用的，看看參數(shù)說(shuō)明

label_format :

a numeric value sets wrap length, alternatively a custom function to format axis labels. by default wraps names longer that 30 characters

原來(lái)這個(gè)參數(shù)默認(rèn)值是30，當(dāng)標(biāo)簽的長(zhǎng)度大于30個(gè)字符就會(huì)被折疊，用多行來(lái)展示。既然問(wèn)題找到了，我們就來(lái)調(diào)節(jié)一下這個(gè)參數(shù)，把他設(shè)置成100，讓我們的標(biāo)簽可以一行展示。

是不是還是原來(lái)的配方，還是熟悉的味道

同樣的柱形圖，我們也能讓他恢復(fù)原來(lái)的容貌。

關(guān)于如何使用R做GO和KEGG富集分析，可參考下文

GO和KEGG富集分析視頻講解