本篇內(nèi)容介紹了“多核中的并行前綴和計算分析”的有關(guān)知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領(lǐng)大家學(xué)習(xí)一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細閱讀,能夠?qū)W有所成!
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1、串行前綴和的計算
如果給定一個數(shù)列a[n],令S[k] = a[0]+a[1]+...+a[k],(k = 0, 1, 2…n-1),數(shù)列S[k]即為數(shù)列a[n]的前綴和。例如下面一列數(shù)據(jù):
a[4] = {1, 2, 3, 4};
其前綴和為
S[0] = a[0] = 1;
S[1] = a[0] + a[1] = 1+ 2 = 3;
S[2] = a[0] + a[1] + a[2] = 1 + 2 + 3 = 6;
S[3] = a[0] + a[1] + a[2] + a[3] = 1 + 2 + 3 + 4 = 10;
前綴和的計算非常簡單,一般地,可以用下面的函數(shù)來進行串行前綴和的計算:
/** 串行前綴和計算函數(shù) @param T * pInput - 輸入數(shù)據(jù) @param T *pOutput - 輸出數(shù)據(jù)(前綴和) @param int nLen - 輸入數(shù)據(jù)長度 @return void - 無 */ templatevoid Sequential_PrefixSum(T * pInput, T *pOutput, int nLen) { int i; pOutput[0] = pInput[0]; for ( i = 1; i < nLen; i++ ) { pOutput[i] = pInput[i] + pOutput[i-1]; } }
在上面的串行前綴和計算代碼中可以看出,每次循環(huán)都依賴于上一次循環(huán)的結(jié)果,因此無法直接對循環(huán)進行并行化,要進行并行化則必須修改計算方法,下面就來看如何進行并行前綴和的計算。
2、并行前綴和的計算
前綴和的并行計算方法有許多種,David Callahan的論文“Recognizing and Parallelizing Bounded Recurrences”中給出了一種適合共享存儲多處理器系統(tǒng)中的有界遞歸計算的通用方法,前綴和計算屬于有界遞歸計算的一個特例。下面先以一個實例來講解整個并行計算的過程:
例:假設(shè)有4個處理器要計算16個整數(shù)的前綴和,這16個整數(shù)如下:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
第1步,先將上面數(shù)據(jù)平分成4組,每個處理器各計算一組數(shù)據(jù)的前綴和,如下所示:
(1 2 3 4)(5 6 7 8)(9 10 11 12)(13 14 15 16)
(1 3 6 10)(5 11 18 26)(9 19 30 42)(13 27 42 58)
第2步,選取每組數(shù)據(jù)的***一個數(shù)據(jù),對這幾個數(shù)據(jù)計算前綴和,如下所示:
(1 3 6 10)(5 11 18 26)(9 19 30 42)(13 27 42 58)
(1 3 6 10)(5 11 18 36)(9 19 30 78)(13 27 42 136)
經(jīng)過這步的計算后,可以很容易發(fā)現(xiàn),每組的***一個數(shù)據(jù)的值已經(jīng)變成了原始數(shù)據(jù)在它所處位置之前(包含本位置)的所有數(shù)據(jù)的和。例如:
36= 1 + 2 + 3 + 4 + 5 + 6 + 7 + 8
78 = 1 + 2 + 3 + 4 + 5 + 6 + 7 + 8 + 9 + 10 + 11 + 12
第3步:從第2組數(shù)開始,將每組中的數(shù)(除***一個數(shù)外)加上它的前一組數(shù)的***一個數(shù),即可得到所有數(shù)的前綴和。如下所示:
(1 3 610) (5+10 11+10 18+1036)(9+36 19+36 30+3678) (13+78 27+78 42+78136)
(1 3 6 10) (15 21 28 36) (45 55 66 78) (91 105 120 136)
從上面的計算過程可以看出,第1步和第3步都是很容易進行并行化計算,第2步中,由于計算量非常小,用串行計算即可,下面給出上面處理過程的代碼實現(xiàn):
#define MIN_PRARLLEL_PREFIXSUM_COUNT 8192 /** 并行前綴和計算函數(shù) @param T * pInput - 輸入數(shù)據(jù) @param T *pOutput - 輸出數(shù)據(jù)(前綴和) @param int nLen - 輸入數(shù)據(jù)長度 @return void - 無 */ templatevoid Parallel_PrefixSum(T * pInput, T *pOutput, int nLen) { int i; int nCore = omp_get_num_procs(); if ( nCore < 4 || nLen < MIN_PRARLLEL_PREFIXSUM_COUNT ) { Sequential_PrefixSum(pInput, pOutput, nLen); return; } int nStep = nLen / nCore; if ( nStep * nCore < nLen ) { nStep += 1; } #pragma omp parallel for num_threads(nCore) for ( i = 0; i < nCore; i++ ) { int k; int nStart = i * nStep; int nEnd = (i+1) * nStep; if ( nEnd > nLen ) { nEnd = nLen; } pOutput[nStart] = pInput[nStart]; for ( k = nStart+1; k < nEnd; k++ ) { pOutput[k] = pInput[k] + pOutput[k-1]; } } for ( i = 2; i < nCore; i++ ) { pOutput[i * nStep - 1] += pOutput[(i-1) * nStep - 1]; } pOutput[nLen-1] += pOutput[(nCore-1)*nStep - 1]; #pragma omp parallel for num_threads(nCore-1) for ( i = 1; i < nCore; i++ ) { int k; int nStart = i * nStep; int nEnd = (i+1) * nStep - 1; if ( nEnd >= nLen ) { nEnd = nLen - 1; } for ( k = nStart; k < nEnd; k++ ) { pOutput[k] += pOutput[nStart-1]; } } return; }
從上面并行前綴和的計算過程可以看出,它的計算量比串行前綴和的計算增加了差不多一倍,如果考慮程序中的實際開銷,計算增加量還不止一倍。因此在雙核CPU機器上,使用并行前綴和計算沒有任何意義,只有在超過4核CPU機器上,它才有實用價值。
Parallel_PrefixSum()函數(shù)中,先是判斷CPU核數(shù)是否小于4,并且判斷了計算量是否不足,如果兩個判斷條件中有任何一個滿足,則調(diào)用串行前綴核計算函數(shù)進行計算,然后才進行并行前綴和的計算。在并行計算時只是簡單地將計算平攤到各個CPU上,沒有考慮CPU核數(shù)較多情況下計算量平攤到各個CPU核上,線程粒度過小的問題,主要是為了不使代碼看起來過于繁瑣。如有需要可以修改成自動計算出最合適的線程數(shù)量(可能小于CPU核數(shù)),然后并行計算時使用相應(yīng)的線程數(shù)量即可。
“多核中的并行前綴和計算分析”的內(nèi)容就介紹到這里了,感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關(guān)的知識可以關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站,小編將為大家輸出更多高質(zhì)量的實用文章!