這期內(nèi)容當(dāng)中小編將會給大家?guī)碛嘘P(guān)如何理解IMGT和HLA數(shù)據(jù)庫，文章內(nèi)容豐富且以專業(yè)的角度為大家分析和敘述，閱讀完這篇文章希望大家可以有所收獲。

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IMGT/HLA 數(shù)據(jù)庫收錄了HLA不同Allel 的序列信息，網(wǎng)址如下

https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/

最近更新日期為2018年7月11號，版本為3.33.0, 數(shù)據(jù)庫中收錄的信息如下

1. 數(shù)據(jù)概覽

數(shù)據(jù)庫中主要收錄了HLA I 型和II 型基因的Allel信息，此外，還包含了一些非HLA基因的Allel

2. HLA I 型

對于HLA-I 型基因，包含了經(jīng)典的HLA-A, HLA-B, HLA-C 等基因，此外，還有部分假基因

3. HLA II 型

HLA II 型基因主要包含了DR, DQ, DP, DO, DM系列基因

4.  其他基因

包含了HFE, MICA, MICB, TAP1, TAP2這幾個基因

對于不同的Allel,  除了WHO委員會指定的標(biāo)準(zhǔn)命名外，還提供了一個HLA編號，示意圖如下

在如下鏈接中，可以查看每個allel的詳細情況

https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/docs/version_r3330.html

帶下劃線的都是超鏈接，可以點擊查看詳細情況。以A*01:01:01:14為例，詳細信息如下

該數(shù)據(jù)庫還提供了FTP服務(wù)，用于下載不同Allel的基因或者蛋白序列,鏈接如下

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/ipd/imgt/hla/

在FTP中，提供了fasta, msf, pir等多種格式，通常下載fasta就可以了，同時提供了dna, rna, protein 3個不同水平的序列

上述就是小編為大家分享的如何理解IMGT和HLA數(shù)據(jù)庫了，如果剛好有類似的疑惑，不妨參照上述分析進行理解。如果想知道更多相關(guān)知識，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道。