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成都創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站制作重慶分公司

circos中的pattern怎么使用

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創(chuàng)新互聯(lián)是一家業(yè)務(wù)范圍包括IDC托管業(yè)務(wù),虛擬空間、主機(jī)租用、主機(jī)托管,四川、重慶、廣東電信服務(wù)器租用,多線服務(wù)器托管,成都網(wǎng)通服務(wù)器托管,成都服務(wù)器租用,業(yè)務(wù)范圍遍及中國大陸、港澳臺以及歐美等多個(gè)國家及地區(qū)的互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)服務(wù)公司。

在官網(wǎng)提供的配置文件示例中,經(jīng)常會(huì)見到pattern這個(gè)參數(shù)。這個(gè)參數(shù)的作用和fill_color類似,都用于指定填充的樣式,只不過fill_color使用顏色進(jìn)行填充,pattern則用點(diǎn)和線進(jìn)行填充。

hisograms, heatmap,links這3種block 中,可以使用pattern參數(shù),指定填充的樣式,用法如下:

pattern = checker

pattern參數(shù)的取值范圍包括以下9種:

  1. solid

  2. hline

  3. hline-sparse

  4. vline

  5. vline-sparse

  6. checker

  7. checker-sparse

  8. dot

  9. dot-sparse

在軟件的安裝目錄下的etc/patterns.conf中,保存了pattern的配置信息

circos中的pattern怎么使用

tiles目錄下,可以找到每種樣式對應(yīng)的圖片。根據(jù)名字,可以把分成以下5大類別

1. solid

circos中的pattern怎么使用

2. hlines

hlines :

circos中的pattern怎么使用
hlines-sparse :

circos中的pattern怎么使用

3. vlines

vlines :

circos中的pattern怎么使用
vline-sparse:

circos中的pattern怎么使用

4. checker

checkers :

circos中的pattern怎么使用
checkers-sparse:

circos中的pattern怎么使用

5. dots

dots :

circos中的pattern怎么使用
dots-sparse :

circos中的pattern怎么使用

solid代表完全填充,hlines代表水平線填充,vlines代表豎線填充,checker代表格子填充,dots代表用點(diǎn)填充;加上sparse后綴,相比不加后綴時(shí),會(huì)稀疏一點(diǎn)。

pattern默認(rèn)的樣式都是白底黑字,可以結(jié)合color屬性來改變其顏色。有以下兩種寫法:

1. 指定一個(gè)具體的顏色

示例

color = red
pattern = hlines

此時(shí)白色的背景依然不會(huì)變,但是默認(rèn)的黑色的字體會(huì)替換成紅色

2. 指定替換的模式

示例

color = white:red,black:orange

冒號分隔的兩個(gè)顏色代表替換的意思,white:red表示將默認(rèn)的白色背景替換成紅色,black:orange代表將黑色替換成橙色。

結(jié)合patterncolor, 可以使得填充更加的多元化??匆粋€(gè)例子

circos中的pattern怎么使用

對應(yīng)的配置文件為

<>
<>
<>
karyotype = data/karyotype/karyotype.human.txt

<>

chromosomes_units           = 1000000
chromosomes_display_default = yes


file   = data/8/15/links.txt
ribbon = yes
flat   = yes
radius        = 0.95r
bezier_radius = 0r
crest         = 0.2


condition  = rand() < 0.5
pattern    = eval((qw(hline vline checker dot))[rand(4)])
color      = black:dblue,white:vlblue
z          = 10


condition  = rand() < 0.5
pattern    = eval((qw(hline vline checker dot))[rand(4)])
z          = 5




<>

感謝各位的閱讀,以上就是“circos中的pattern怎么使用”的內(nèi)容了,經(jīng)過本文的學(xué)習(xí)后,相信大家對circos中的pattern怎么使用這一問題有了更深刻的體會(huì),具體使用情況還需要大家實(shí)踐驗(yàn)證。這里是創(chuàng)新互聯(lián),小編將為大家推送更多相關(guān)知識點(diǎn)的文章,歡迎關(guān)注!


新聞名稱:circos中的pattern怎么使用
網(wǎng)頁地址:http://weahome.cn/article/ihpgdc.html

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