如何進行miRNA相關(guān)GO和KEGG功能分析，相信很多沒有經(jīng)驗的人對此束手無策，為此本文總結(jié)了問題出現(xiàn)的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。

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對于mRNA數(shù)據(jù)，我們經(jīng)常通過GO和KEGG富集分析來進行功能分析，對于miRNA數(shù)據(jù)而言，我們可以通過miRNA對應(yīng)的mRNA來研究miRNA相關(guān)功能。
miRpath是一個在線網(wǎng)站，集成了miRNA靶基因數(shù)據(jù)庫, 只需要輸入感興趣的miRNA Id, 就可以從靶基因數(shù)據(jù)庫中獲取miRNA對應(yīng)的靶基因，然后進行GO和KEGG富集分析

該數(shù)據(jù)庫中集成以下3個miRNA靶基因數(shù)據(jù)庫

1. TarBase

2. TargetScan

3. microT-CDS

支持以下幾個物種的GO和KEGG富集分析

1. Human

2. Mouse

3. D.melanogaster

4. C.elegans

5. R.Norvegicus

6. D.Rerio

7. G.Gallus

該數(shù)據(jù)庫有以下兩種使用方式

1. 正向檢索

正向檢索功能用于分析指定miRNA的功能，輸入框如下所示

通過Species選擇對應(yīng)物種，在Add miRNAs框中輸入感興趣的miRNA ID，然后選擇對應(yīng)的靶基因數(shù)據(jù)庫即可，kegg pathway運行結(jié)果如下所示

這個結(jié)果其實就是將輸入的所有miRNA的靶基因集合進行富集分析，點擊details， 可以查看每個miRNA靶基因單獨富集分析結(jié)果，示意如下

點擊see genes, 可以查看具體的基因列表，示意如下

點擊pathway union, 通過show heatmap可以得到如下所示的熱圖

這種熱圖反應(yīng)的是每個miRNA靶基因的富集分析結(jié)果，每一行代表一個miRNA, 每一列代表一個pathway, 單元格的顏色該通路下富集的p值決定。

2. 反向檢索

反向檢索功能用于發(fā)現(xiàn)調(diào)控指定的GO或者pathway下基因的miRNA, 示意如下

我們可以以miRpath作為參考，利用其他數(shù)據(jù)庫或者自己構(gòu)建的高質(zhì)量miRNA靶基因數(shù)據(jù)來進行富集分析，從而研究miRNA相關(guān)功能。

看完上述內(nèi)容，你們掌握如何進行miRNA相關(guān)GO和KEGG功能分析的方法了嗎？如果還想學(xué)到更多技能或想了解更多相關(guān)內(nèi)容，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，感謝各位的閱讀！