這篇文章主要介紹了HPA是什么數(shù)據(jù)庫，具有一定借鑒價(jià)值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。

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HPA全稱是Human Protein Atls， 利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，從RNA和蛋白水平研究人類不同組織和器官中的蛋白表達(dá)情況，網(wǎng)址如下

https://www.proteinatlas.org/

根據(jù)32個(gè)不同組織中蛋白編碼基因的RNA_seq數(shù)據(jù)，將基因進(jìn)行了分類，結(jié)果如下所示

鑒于分泌蛋白，膜相關(guān)蛋白在病理生理學(xué)中的重要作用，將蛋白劃分了下圖所示的不同類別進(jìn)行研究

通過不同組織中的RNA_seq數(shù)據(jù)，分析了蛋白編碼基因在不同組織中的富集情況，如下所示

可以看到在腦組織中，膜香瓜蛋白較多，而在肺中，分泌蛋白較多。除了對不同組織/細(xì)胞中的蛋白表達(dá)進(jìn)行比較分析，還進(jìn)一步研究了不同腫瘤中蛋白的表達(dá)情況。

在HPA中，又進(jìn)一步劃分成了以下3個(gè)子類

1. The  Tissus Atlas

用于查看和分析蛋白編碼基因在不同組織和器官中的表達(dá)情況，以MYL7為例，鏈接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000106631-MYL7/tissue
結(jié)果示意如下

2. The Cell Atlas

提供了蛋白編碼基因在不同細(xì)胞系中的表達(dá)情況，同時(shí)還體用了對應(yīng)的亞細(xì)胞定位信息，以CCNB1為例，鏈接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000134057-CCNB1/cell

結(jié)果示意如下

3. The Pathology Atlas

提供了基因在腫瘤組織中的表達(dá)情況，以及生存分析，病理學(xué)圖像等結(jié)果，以MK167為例，鏈接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000148773-MKI67/pathology

結(jié)果示意如下

通過HPA數(shù)據(jù)庫，可以方便的探究蛋白編碼基因在正常和腫瘤組織/器官中的表達(dá)情況。

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