這篇文章將為大家詳細(xì)講解有關(guān)LincSNP數(shù)據(jù)庫有什么用，小編覺得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

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lncRNA在疾病的發(fā)生與發(fā)展中發(fā)揮著重要作用，但是具體的角色是什么，就需要深入挖掘和探究。

在過去通過GWAS分析鑒定出了非常多的與疾病相關(guān)的SNP位點(diǎn)，最直接簡單的分析當(dāng)然是首選那些位于蛋白編碼基因上的SNP位點(diǎn)，就像蛋白編碼基因只占了基因總數(shù)的很小一部分一樣，位于蛋白編碼基因上的SNP位點(diǎn)也只占了所有SNP位點(diǎn)中很小一部分比例。

在剩余大部分SNP位點(diǎn)中，有一類位點(diǎn)引起了科學(xué)家的關(guān)注，那就是位于lncRNA相關(guān)的SNP位點(diǎn)。通過探究這些位于lncRNA基因上的SNP位點(diǎn)，為我們研究lncRNA在疾病中的角色和作用提供了打開了一個新的視角。

lncRNA相關(guān)的SNP位點(diǎn)包括以下兩類

1. 位于lncRNA基因區(qū)域的SNP位點(diǎn)

2. 位于lncRNA基因轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合區(qū)域的SNP位點(diǎn)

無論是直接位于lncRNA的基因上，還是位于調(diào)控該基因的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，SNP位點(diǎn)的存在都對lncRNA的轉(zhuǎn)錄造成了一定的影響，通過SNP-lncRNA-disease的策略，來篩選相關(guān)的SNP位點(diǎn)來重點(diǎn)研究，基于這個思路，有很多已經(jīng)發(fā)表的文獻(xiàn)，有科研工作者收集整理這類文獻(xiàn)，并將其中的信息做成了數(shù)據(jù)庫，就是LincSNP,網(wǎng)址如下

http://210.46.80.146/lincsnp/index.html

目前版本為2.0，通過Linc-confirm菜單，可以發(fā)現(xiàn)文獻(xiàn)中發(fā)表的與疾病相關(guān)的lncRNA SNP位點(diǎn)，示意如下

通過Linc-Score功能，可以檢索特定lncRNA基因相關(guān)的疾病，示意如下

該數(shù)據(jù)庫是免費(fèi)下載

該數(shù)據(jù)庫以SNP位點(diǎn)為橋梁，建立起了lncRNA與疾病之間的關(guān)聯(lián)，這個思路值得借鑒。

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