這篇文章將為大家詳細(xì)講解有關(guān)Dfam數(shù)據(jù)庫有什么用，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

在臨漳等地區(qū)，都構(gòu)建了全面的區(qū)域性戰(zhàn)略布局，加強發(fā)展的系統(tǒng)性、市場前瞻性、產(chǎn)品創(chuàng)新能力，以專注、極致的服務(wù)理念，為客戶提供成都網(wǎng)站設(shè)計、成都做網(wǎng)站 網(wǎng)站設(shè)計制作定制網(wǎng)站開發(fā),公司網(wǎng)站建設(shè),企業(yè)網(wǎng)站建設(shè),成都品牌網(wǎng)站建設(shè),營銷型網(wǎng)站,外貿(mào)網(wǎng)站建設(shè),臨漳網(wǎng)站建設(shè)費用合理。

Transposable elements 轉(zhuǎn)座元件占真核生物基因組很大一部分，對轉(zhuǎn)座元件的精確注釋有助于研究其生物學(xué)特性，揭示基因組的進化過程。

Dfam數(shù)據(jù)庫對多個真核生物的轉(zhuǎn)座元件進行多序列比對，構(gòu)建了轉(zhuǎn)座元件的家族信息。官網(wǎng)如下

http://www.dfam.org/

目前最新版本為Dfam 2.0, 對于每個家族，以DF編號唯一標(biāo)識，示意圖如下

Dfam同時還提供了一個隱馬爾可夫模型，可以用于序列比對，下載地址如下

http://www.dfam.org/web_download/Release/Dfam_2.0/

和Dfam類似，還有一個Dfam Consensus 數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫對基因組上的重復(fù)序列進行了詳細(xì)分類，鏈接如下

http://www.dfam-consensus.org/#/public/te_classes/

Low_Complexity代表低復(fù)雜度序列，指的是富含某些堿基，比如富含AT的序列；Tandem_Repeat代表串聯(lián)重復(fù)序列，motif長度為2-10bp的串聯(lián)重復(fù)序列稱為Simple_Repeat, 也叫做簡單串聯(lián)重復(fù)序列或者為微衛(wèi)星序列，motif長度在幾百bp左右的串聯(lián)重復(fù)序列，叫做Satellite, 衛(wèi)星DNA序列。

Interspersed_Repeat代表散落在基因組多個地方的重復(fù)序列，比如轉(zhuǎn)座子，假基因等序列。

RepeatMasker會利用這個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)去分析基因組上的重復(fù)序列。該數(shù)據(jù)庫提供了重復(fù)元件的序列信息，可以下載。

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