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DENdb采用5種不同的方法對人類不同細胞系中的增強子進行了預測，同時還提供了增強子區(qū)域與DNA內切酶超敏位點，轉錄因子結合區(qū)域的overlap信息，該數(shù)據(jù)庫網址如下

http://www.cbrc.kaust.edu.sa/dendb/index.php

采用的5種方法列表如下

1. ChromHMM

2. Segway

3. RFECS

4. CSI-ANN

5. ENCODE integrated annotation

該數(shù)據(jù)庫中不同細胞系預測到的增強子數(shù)量匯總如下

每種方法對應的增強子數(shù)量統(tǒng)計如下

目前該數(shù)據(jù)庫的檢索功能已經失效了，只能從下載的文件中查看增強子的相關信息，從下載的enhancers.csv.zip文件中，可以查看每種細胞系中增強子的區(qū)間信息，部分文件內容示意如下

從下載的dnase.csv.zip文件中，可以得到DNAse_seq鑒定到的DNAse酶超敏位點，部分文件內容示意如下

從下載的enhancer_dnase.csv文件中，可以得到增強子與DNase酶超敏位點的交集信息，部分文件內容示意如下

類似的從下載文件也可以得到TFBS以及增強子與TFBS的交集信息，同時還提供了增強子靶基因信息，根據(jù)enhancer_targets.tsv.zip文件可以得到該信息，部分文件內容示意如下

該數(shù)據(jù)庫中的增強子區(qū)間信息是基于hg19版的基因組來定位的， 其預測增強子區(qū)間的方法值得借鑒。

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