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成都創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站制作重慶分公司

用R語言怎么畫小提琴圖

本篇內(nèi)容介紹了“用R語言怎么畫小提琴圖”的有關(guān)知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領(lǐng)大家學習一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細閱讀,能夠?qū)W有所成!

公司主營業(yè)務:成都網(wǎng)站設計、成都網(wǎng)站制作、移動網(wǎng)站開發(fā)等業(yè)務。幫助企業(yè)客戶真正實現(xiàn)互聯(lián)網(wǎng)宣傳,提高企業(yè)的競爭能力。創(chuàng)新互聯(lián)是一支青春激揚、勤奮敬業(yè)、活力青春激揚、勤奮敬業(yè)、活力澎湃、和諧高效的團隊。公司秉承以“開放、自由、嚴謹、自律”為核心的企業(yè)文化,感謝他們對我們的高要求,感謝他們從不同領(lǐng)域給我們帶來的挑戰(zhàn),讓我們激情的團隊有機會用頭腦與智慧不斷的給客戶帶來驚喜。創(chuàng)新互聯(lián)推出江岸免費做網(wǎng)站回饋大家。

 數(shù)據(jù)已經(jīng)存儲到了文件里 首先是讀取數(shù)據(jù)
library(readr)
df<-read_tsv("author_number.tsv")
head(df)
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
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 期刊分別是
table(df$journal)
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
image.png
 首先通過summary()函數(shù)看一些數(shù)據(jù)的基本情況
summary(df)
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
image.png

作者數(shù)量最多的竟然有446人,中位數(shù)是6個人,符合日常認知

我們看一下400多個作者的論文是什么?


library(dplyr)

df%>%
  filter(auth_num == 446) -> df1

df1$id
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
image.png
用R語言怎么畫小提琴圖  
image.png

這個應該是采集了很多人的數(shù)據(jù),可能是把參與實驗的所有人全都列成作者了

 接下來就是小提琴圖展示每個期刊作者數(shù)量的分布了

用原始數(shù)據(jù)作圖代碼和結(jié)果如下

ggplot(df, aes(x=journal, y=auth_num, fill=journal)) +
  geom_violin(scale="width") +
  geom_boxplot(width=.12, 
               fill=I("black"), 
               notch=T,
               outlier.size=NA, 
               col="grey40") +
  stat_summary(fun="median", 
               geom="point", shape=20, col="white") +
  #scale_y_log10(breaks=c(1:5, seq(10, 50, by=10), 100, 200, 300)) +
  coord_flip() + labs(x="", y="Number of authors per paper") +
  theme_classic() + theme(legend.position="none") +
  scale_fill_brewer()
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
image.png

這個結(jié)果不太好看,所有作者對原始數(shù)據(jù)做了log10轉(zhuǎn)化

ggplot(df, aes(x=journal, y=auth_num, fill=journal)) +
  geom_violin(scale="width") +
  geom_boxplot(width=.12, 
               fill=I("black"), 
               notch=T,
               outlier.size=NA, 
               col="grey40") +
  stat_summary(fun="median", 
               geom="point", shape=20, col="white") +
  scale_y_log10(breaks=c(1:5, seq(10, 50, by=10), 100, 200, 300)) +
  coord_flip() + labs(x="", y="Number of authors per paper") +
  theme_classic() + theme(legend.position="none") +
  scale_fill_brewer()
 
用R語言怎么畫小提琴圖  
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log10轉(zhuǎn)換 是一種比較好的方案當數(shù)據(jù)有明顯的離群值的時候

 

這次新學到的知識點包括

lappy()函數(shù)指定參數(shù)

lapply(files_all,
       read_tsv,
       col_type= list(
         col_character(),
         col_character(),
         col_character(),
         col_character())) %>%                
  bind_rows -> data_all  
 

統(tǒng)計字符串中指定字符的數(shù)量

library(stringr)
str_count("A,B,C",pattern=",")

“用R語言怎么畫小提琴圖”的內(nèi)容就介紹到這里了,感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關(guān)的知識可以關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站,小編將為大家輸出更多高質(zhì)量的實用文章!


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