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如何使用R語(yǔ)言中的corrplot來(lái)繪制相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖

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R語(yǔ)言也是目前常用的數(shù)據(jù)分析編程語(yǔ)言之一,目前經(jīng)過(guò)使用者、科學(xué)家們的開(kāi)發(fā),其功能也比較強(qiáng)大。本文就使用R語(yǔ)言中的corrplot來(lái)繪制相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖進(jìn)行介紹。

下面以波士頓Boston的房?jī)r(jià)數(shù)據(jù)為例,這個(gè)數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)挖掘、機(jī)器學(xué)習(xí)中常用的數(shù)據(jù),可以到UCI的機(jī)器學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫(kù)去下載:archive.ics.uci.edu/ml/

數(shù)據(jù)集有506個(gè)觀測(cè)樣本,14個(gè)變量:

如何使用R語(yǔ)言中的corrplot來(lái)繪制相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖

首先,將數(shù)據(jù)導(dǎo)入R軟件中:

> mydata<-read.table('E:/Boston-house-prices.csv',head=T,sep=',',stringsAsFactors = FALSE )
> summary(mydata)

然后計(jì)算相關(guān)系數(shù),并下載相關(guān)系數(shù)矩陣corrplot包:

> res <- cor(mydata)
> install.packages("corrplot") #下載相關(guān)系數(shù)矩陣corrplot包
> corrplot(res, method = "shade",shade.col = NA, tl.col ="black", tl.srt = 45, order = "AOE") # 繪制相關(guān)系數(shù)矩陣圖

得到圖形:

如何使用R語(yǔ)言中的corrplot來(lái)繪制相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖

相關(guān)系數(shù)圖中顏色越深表示,兩個(gè)變量間的相關(guān)系數(shù)越接近1.圖中可以看到,Boston的中位數(shù)房?jī)r(jià)(MEDV)一列中,與LSTAT、PTRATIO、RM等變量間的相關(guān)關(guān)系最大。

下面著重說(shuō)說(shuō)corrplot這個(gè)函數(shù):

在corrplot(res, method = "shade",shade.col = NA, tl.col ="black", tl.srt = 45, order = "AOE") 這條命令中,

res:代表需要可視化的相關(guān)系數(shù)矩陣;

method = "shade"代表指定可視化的方法,可以是圓形、方形、橢圓形、數(shù)值、陰影、顏色或餅圖形,method = c("circle", "square", "ellipse", "number", "shade", "color", "pie");

shade.col = NA:指定圖形展示的顏色,默認(rèn)以均勻的顏色展示;

tl.col:指定文本標(biāo)簽的顏色,即圖形的文字標(biāo)簽是什么顏色的,默認(rèn)為黑色;

tl.srt = 45,表示文字標(biāo)簽的大小;

order = "AOE":指定相關(guān)系數(shù)排序的方法,可以是原始順序(original)、特征向量角序(AOE)、第一主成分順序(FPC)、層次聚類(lèi)順序(hclust)和字母順序,一般”AOE”排序結(jié)果都比”FPC”要好,order = c("original", "AOE", "FPC", "hclust", "alphabet")。

根據(jù)corrplot函數(shù)不同的屬性,可以變換屬性,繪制不同的相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖:

如何使用R語(yǔ)言中的corrplot來(lái)繪制相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖

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