這篇文章主要介紹了LncMAP數(shù)據(jù)庫有什么用，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。

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轉(zhuǎn)錄調(diào)控對疾病的影響是研究的熱點之一，除了研究轉(zhuǎn)錄因子和TF之間這種直接的調(diào)控作用，科學家發(fā)發(fā)現(xiàn)lncRNA也可以參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控，通過lncRNA-TF-gene的調(diào)控網(wǎng)絡。
LncMAP數(shù)據(jù)庫收集整理了20多種腫瘤中相關(guān)的lncRNA-TF-gene調(diào)控網(wǎng)絡信息，網(wǎng)址如下

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncMAP/index.jsp

腫瘤類型和對應的lncRNA調(diào)控網(wǎng)絡數(shù)量統(tǒng)計圖示如下

通過LncRNA-TF-Gene Tripet可以檢索對應的調(diào)控網(wǎng)絡，檢索框如下所示

選擇腫瘤類型，然后輸入lncRNA, TF, Target gene中的任意一個都可以，以PVT1這個lncRNA為例，檢索結(jié)果如下

每一行代表一個lncRNA-TF-gene三角關(guān)系對，點擊Network按鈕，可以查看對應的網(wǎng)絡圖，示意如下

點擊more按鈕，可以查看詳細信息，包括lncRNA，TF, gene在腫瘤患者和正常人中的表達量

與之類似的，還提供了Drug-lncRNA, TF-gene之間的相互作用網(wǎng)絡，通過對應的導航欄都可以方便的查找結(jié)果，展示形式和上面的lnRNA-TF-gene基本相同。

數(shù)據(jù)庫中的信息是開發(fā)團隊基于TCGA數(shù)據(jù)庫中的轉(zhuǎn)錄組表達譜數(shù)據(jù)分析得到的，通過在線服務，我們可以方便的查看所有的lncRNA-TF-Gene調(diào)控網(wǎng)絡結(jié)果。

感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“LncMAP數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持創(chuàng)新互聯(lián)，關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，更多相關(guān)知識等著你來學習!