這篇文章將為大家詳細(xì)講解有關(guān)odd ratio值在關(guān)聯(lián)分析中的含義是什么,文章內(nèi)容質(zhì)量較高,因此小編分享給大家做個(gè)參考,希望大家閱讀完這篇文章后對(duì)相關(guān)知識(shí)有一定的了解。
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在GWAS分析中,利用卡方檢驗(yàn),費(fèi)舍爾精確檢等方法,通過(guò)判斷p值是否顯著,我們可以分析snp位點(diǎn)與疾病之間是否存在關(guān)聯(lián),然而這得到的僅僅是一個(gè)定性的結(jié)論,如果存在關(guān)聯(lián),其關(guān)聯(lián)性究竟有多強(qiáng)呢?
很顯然,我們需要一個(gè)量化指標(biāo)來(lái)描述關(guān)聯(lián)的強(qiáng)弱程度。類似于相關(guān)性檢驗(yàn),通過(guò)p值只能夠說(shuō)明兩個(gè)變量是否相關(guān)。至于其相關(guān)性的大小,是正相關(guān)還是負(fù)相關(guān),還需要結(jié)合相關(guān)系數(shù)來(lái)作出判斷。在關(guān)聯(lián)分析中的”相關(guān)系數(shù)”則對(duì)應(yīng)兩個(gè)常用的統(tǒng)計(jì)量, risk ratio和odd ratio。
以探究吸煙和肺癌之間的關(guān)聯(lián)為例,基于的數(shù)據(jù)格式如下
肺癌 | 正常個(gè)體 | |
---|---|---|
吸煙 | a | b |
不吸煙 | c | d |
risk ratio, 也叫做relative risk, 簡(jiǎn)寫(xiě)為RR, 通常稱之為相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度,是暴露組的發(fā)病率與非暴露組的發(fā)病組的比值。對(duì)于上述數(shù)據(jù),RR的計(jì)算過(guò)程如下
吸煙組患肺癌的比例 a / (a + b)
不吸煙組患肺癌的比例 c / (c + d)
RR = (a / (a + b)) /( c / (c + d))
RR的數(shù)值大小直觀的反映了暴露因素中發(fā)病率的大小,RR>1, 暴露組中發(fā)病率大于非暴露組的發(fā)病率,說(shuō)明暴露因素和發(fā)病率是正相關(guān)關(guān)系,反之,RR<1, 暴露組中發(fā)病率小于非暴露組的發(fā)病率,說(shuō)明暴露因素和發(fā)病率是父相關(guān)關(guān)系。如果RR = 1, 兩組發(fā)病率相等,說(shuō)明暴露因素和發(fā)病率沒(méi)有關(guān)聯(lián)。
值得一提的是,在計(jì)算過(guò)程中使用了抽樣數(shù)據(jù)的頻率來(lái)代表發(fā)病的概率,這個(gè)只有當(dāng)抽樣數(shù)目非常大才適用, 所以RR值適用于大規(guī)模的隊(duì)列樣本。對(duì)于常規(guī)的case/control研究,其抽樣的數(shù)目都達(dá)不到這樣的規(guī)模。所以不能直接用上述公式來(lái)計(jì)算RR,進(jìn)一步提出了odd ratio的概念。
對(duì)于罕見(jiàn)疾病,患病的個(gè)體數(shù)量遠(yuǎn)小于正常組的數(shù)量,出于這樣的考慮,將上述模型做一個(gè)簡(jiǎn)化處理,a + b 的值用b里表示,c + d的值有d 來(lái)表示,因?yàn)閍遠(yuǎn)小于b, c遠(yuǎn)小于d, 幾乎可以忽略不計(jì),此時(shí)上述公式就變成了
(a / b) / (c / d) = (a d) /( b c)
這個(gè)公式計(jì)算出的結(jié)果就是odd ratio, 簡(jiǎn)稱OR, 也叫做優(yōu)勢(shì)比,交叉乘積比等。從上述轉(zhuǎn)換可以看出來(lái),OR其實(shí)是RR的一個(gè)估計(jì)值,其含義和RR值相同。
通過(guò)OR值來(lái)定量描述關(guān)聯(lián)性的大小, 使得我們可以直觀比較不同因素和疾病之間關(guān)聯(lián)性的強(qiáng)弱,有助于篩選強(qiáng)關(guān)聯(lián)的因素。
關(guān)于odd ratio值在關(guān)聯(lián)分析中的含義是什么就分享到這里了,希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助,可以學(xué)到更多知識(shí)。如果覺(jué)得文章不錯(cuò),可以把它分享出去讓更多的人看到。