用法:assign(x, value, pos = -1, envir = as.environment(pos),? inherits = FALSE, immediate = TRUE)
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assign函數(shù)在循環(huán)時候,給變量賦值。
舉例說明:
1、
for (i in 1:(length(rowSeq)-1)){
assign(paste("nginx_server_fields7_", i, sep = ""), nginx_server_fields7[(rowSeq[(i-1)+1]):(rowSeq[i+1]), ])
}
2、
for (i in 1:3){
assign(paste("a", i, sep = ""), i:10)
}
ls()
[1] "a1" "a2" "a3" "i"
a1
[1]? 1? 2? 3? 4? 5? 6? 7? 8? 9 10
a2
[1]? 2? 3? 4? 5? 6? 7? 8? 9 10
a3
[1]?3? 4? 5? 6? 7? 8? 9 10
1、paste函數(shù)可用于字符串連接
用法:paste (..., sep = " ", collapse = NULL),分隔符默認為空格
我們簡單舉個例子
1)paste("a","b") ##能連接a b
[1] "a b"
paste("a","b","c")
[1] "a b c"
2)設置分隔符paste("a","b",sep="=") ##注意到用等號分隔了
[1] "a=b"
3)連接多個元素paste("a",1:5,sep="") ##會自動每個元素與a相連
[1] "a1""a2""a3""a4""a5"
4)paste("a",1:5,".pdf",sep="") ##比如想批量輸出文件名
[1] "a1.pdf""a2.pdf""a3.pdf""a4.pdf""a5.pdf"、
2、collapse參數(shù)
謝益輝大佬說這個參數(shù)引無數(shù)英雄競折腰啊,大家只會sep
1)paste("a",1,collapse="+") ##注意到了吧,collapse沒用上
[1] "a 1"
2)paste(c("a","b","c"),collapse="+") ##這樣就很容易理解了,collapse折疊起了元素
[1] "a+b+c"
3)paste("a",1:5,sep="") ##再來更明顯的舉例
[1] "a1""a2""a3""a4""a5"
4)paste("a",1:5,sep="",collapse="+")?##先在元素間連接,然后折疊
[1] "a1+a2+a3+a4+a5"
3、與paste0函數(shù)的區(qū)別
paste0函數(shù),默認sep=""是兩個函數(shù)唯一的區(qū)別
paste(c("a","b","c"),1:3)##默認空格符
[1] "a 1""b 2""c 3"
paste(c("a","b","c"),1:3,sep=" ")
[1] "a 1""b 2""c 3"
paste(c("a","b","c"),1:3,sep="")
[1] "a1""b2""c3"
如果兩個向量長度不同paste(c("a","b","c"),1:5) ##超出范圍后繼續(xù)從前向后連接
[1] "a 1"? "b 2"? "c 3"? "a 4"? "b 5"
paste0(c("a","b","c"),1:3)#默認元素連接為sep=""
[1] "a1""b2""c3"
用法:unlist()函數(shù)的作用,就是將list結構的數(shù)據(jù)du,變zhi成非list的數(shù)據(jù),即將list數(shù)據(jù)變成 字符串向量 或者數(shù)字向量的形式
如果是向量的話就直接輸出向量
例子:
%in%相當于match()函數(shù)的一個縮寫。用來判斷一個數(shù)組或矩陣是否包含在另一個數(shù)組或矩陣里。舉個例子一目了然:
#首先復制兩個變量a和b
a?-?1:5
b?-?3:7
a?%in%?b????#看a的元素是否包含在b中輸出結果如下:
[1]?FALSE?FALSE??TRUE??TRUE??TRUE
用法:apply(x, MARGIN, FUN, ...)
作用:對 矩陣 的行或列使用函數(shù),或者對 數(shù)組 的各個維度使用函數(shù)
x為數(shù)據(jù)對象,MARGIN是維度的下標,MARGIN=1表示行,MARGIN=2表示列,F(xiàn)UN是自己指定的任意或自定義函數(shù)
注:數(shù)據(jù)框dataframe也可以使用apply函數(shù),該函數(shù)會自動將數(shù)據(jù)框轉化為矩陣,但前提是數(shù)據(jù)框中各列的數(shù)據(jù)類型 必須是數(shù)值型,否則會報錯。
用法:lapply(x,FUN,...)
作用:對列表中的各個元素使用函數(shù)
x是格式為列表的數(shù)據(jù)源,F(xiàn)UN是任意函數(shù)。
intersect(data1,data2):交集
union(data1,data2):并集
r語言中的c()函數(shù),用來把一些數(shù)據(jù)組合成向量。
如:x-c(1,2)
把1,2兩個數(shù),組合成向量(1,2),并存入變量x。
C語言中,函數(shù)調用的一般形式為:
函數(shù)名(實際參數(shù)表)
對無參函數(shù)調用時則無實際參數(shù)表。實際參數(shù)表中的參數(shù)可以是常數(shù)、變量或其它構造類型數(shù)據(jù)及表達式。各實參之間用逗號分隔。
#includestdio.h
int?fun(int?x,?int?y);?//?函數(shù)聲明,如果函數(shù)寫在被調用處之前,可以不用聲明
void?main()
{
int?a=1,?b=2,?c;
c?=?fun(a,?b);?//?函數(shù)的調用,調用自定義函數(shù)fun,其中a,b為實際參數(shù),傳遞給被調用函數(shù)的輸入值
}
//?自定義函數(shù)fun
int?fun(int?x,?int?y)??//?函數(shù)首部
{??//?{}中的語言為函數(shù)體
return?xy???x?:?y;??//?返回x和y中較大的一個數(shù)
}
擴展資料
C語言中不允許作嵌套的函數(shù)定義。因此各函數(shù)之間是平行的,不存在上一級函數(shù)和下一級函數(shù)的問題。但是C語言允許在一個函數(shù)的定義中出現(xiàn)對另一個函數(shù)的調用。
這樣就出現(xiàn)了函數(shù)的嵌套調用。即在被調函數(shù)中又調用其它函數(shù)。這與其它語言的子程序嵌套的情形是類似的。其關系可表示如圖。
圖表示了兩層嵌套的情形。其執(zhí)行過程是:執(zhí)行main函數(shù)中調用a函數(shù)的語句時,即轉去執(zhí)行a函數(shù),在a函數(shù)中調用b 函數(shù)時,又轉去執(zhí)行b函數(shù),b函數(shù)執(zhí)行完畢返回a函數(shù)的斷點繼續(xù)執(zhí)行,a函數(shù)執(zhí)行完畢返回main函數(shù)的斷點繼續(xù)執(zhí)行。
參考資料:函數(shù)調用_百度百科
1. 判斷存在:一個元素是不是在向量中用 a%in%b
a="TT"
b=c("AA","AT","TT")
a %in% b
[1] TRUE
2. 判斷某一元素這向量中的索引(第幾個位置): index.TT=which(b==”TT”)
index.TT=which(b=="TT")#index.TT是想知道的索引號,which是判斷函數(shù),b是想知道的元素所在的向量
index.TT
[1] 3
3. 相當于 python 中的字典, names 函數(shù)
b
[1] "AA" "AT" "TT"
names(b)=c("geno1","geno2","geno3")#geno mean genotype
names(b)
[1] "geno1" "geno2" "geno3"
names(b)[1]
[1] "geno1"
names(b)[1]="test"
names(b)
[1] "test""geno2" "geno3"
names(b)=NULL
b
[1] "AA" "AT"
b["geno2"]
"AT"
pop_name=c(“CEU”,"YRI")
names(pop_name)=c(1,2)
names(pop_name[1])=1
4. 去除某一元素: b[-index.nu]
#想去除元素”TT”,如果你不知道是第幾個索引,可以先判斷索引,再刪除。
b=c("AA","AT","TT")
names(b)=c("geno1","geno2","geno3")
index.TT=which(b=="TT")
b=b[-index.TT]
b
geno1 geno2
"AA""AT"
5. 相當于 Python 中的 set() 函數(shù) 和 count() 函數(shù): unique() , table()
b=c("TT","AT","AT","TT","AA")
unique(b)#即相當于去除所有的重復,只保留一個
[1] "TT" "AT" "AA"
table(b)#以元素為name,統(tǒng)計各元素的個數(shù)
b
AA AT TT
122
6. 字符串的分割: strsplit()
test="AA"
strsplit(test)
錯誤于strsplit(test) :缺少參數(shù)"split",也沒有缺省值
strsplit(test,split='')
[[1]]
[1] "A" "A"
test=strsplit(test,split='')[[1]]
test
[1] "A" "A"
7. 文本文檔的寫入: write.table()
write.table( res.matrix,file=new.file,sep='\t',quote=F,row.names=F,col.names=F,append=T)#quote=F去掉引號后寫入,row.names=F去掉行的名字寫入,否則會把名字寫進去
##寫入數(shù)據(jù)時候最好把數(shù)據(jù)存儲成一個matrix然后直接寫。要是每行每行寫的話要注意數(shù)據(jù)的格式了。先建立一個空的matrix,見8,然后通過rbind或者cbind疊加上去。
方法一:
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=c(a,b)
}
write.table(a,file=”test.txt”)#你會發(fā)現(xiàn)結果是
AA
TT
CC
….
##而且還有行和列的名字,因為沒有設置參數(shù)。因為對于c向量來說,寫的話默認是豎著寫的,每個元素占一行。所以比較方便的就是rbind
方法二:
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=rbind(a,b)
}
write.table(a,file=”test.txt”,quote=F,row.names=F,col.names=F)#你會發(fā)現(xiàn)結果是
AA TT CC
AA TT CC
AA TT CC
##原因是rbind把最總結果當做矩陣了。對于R數(shù)據(jù)的寫入最好能生成最后的矩陣再寫入。但是西面的梅一行寫一次和方法二的效果是想通的,但是要用到append參數(shù)。
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=rbind(a,b)
write.table(a,file=”test.txt”,quote=F,row.names=F,col.names=F,append=T)
}
8. 建立一個空的 matrix :
res.matrix - matrix( ,nrow=0,ncol=6 )##這樣就建立了一個0行6列的空matrix了。
9. 如何將 R 運行結果輸出到文件
x=read.table("F:/my/work/chengxu/PValue/pc2jieguo/pc2302.txt")
z=t(x)
ks.test(y,z)
Two-sample Kolmogorov-Smirnov test
data:y and z
D = 0.207, p-value 2.2e-16
alternative hypothesis: two-sided
如上面運行結果,我想將p-value 2.2e-16自動保存到一個文件中,如何用R程序實現(xiàn),謝謝!
sink("output.txt")
print(ks.test(y,z)$p.value)
sink()
10 降序排列:
a=c(1,1.2,0.1,4,5,-0.1)
a=sort(a,decreasing=T)
a
[1]5.04.01.21.00.1 -0.1
11. 取前1%的數(shù)
a=c(1:10,4:20,1:100,1:1000)
a=sort(a,decreasing=T)#先降序
sig=a[round(length(a)*0.01)]
sig
[1] 990
12.在shell中直接執(zhí)行R腳本
R CMD BATCH --argstest.R
13. R中高級作圖的方法
14:設置字體類型:
par(family='Times New Roman')
15:控制圖形四周的空白大小
par(mfrow=c(3,1),mar=c(0,0,0,0))
其中mar是四周的間距,分別為x,y上下的距離
16控制作圖區(qū)域的大小layout
layout(c(1,2,3),height=c(1,1,0.5))
分成豎著三份, 其中三份比列依次為(高度依次為2:2:1)
17保留兩位小數(shù)
round(0.123,digits=2)
18 在原有圖的基礎上畫圖:
par(fig=c(0.1,0.5,0.43,0.65), new=TRUE)
19 只顯示y軸
plot(1:10,1:10,axes=F)
axis(2,at.....)
20 調節(jié)刻度方向 las
plot(1:10,1:10,las=1)
21 屏幕分割
layout(matrix(1:16,4,4))###豎著plot
par(mfrow=c(4,4))##橫著plot
22.邏輯表示或者
xor為異或,兩值不等為真,兩值相等為假。例:xor(0, 1)
23. 從向量中隨機取幾個數(shù)sample
sample(rep(1:1000),10)
23 字符串轉換成小數(shù)浮點型
as.numeric("0.123")
24. 讀取不規(guī)范的文本
f=readLines(afile,n=1)#n表示讀幾行
f=strsplit(f,'\t')##分割
f[1][[1]]##第一行
f[1][[1]][1]##第一行 第一個字符串
25. write 寫入文件
write(afile, "a\tb\t",append=T) #沿著每行一次 寫入
26. 不需要循環(huán),這直接對matrix沒行或者每列進行篩選操作apply()
apply(data,col2 or row1, max0)
27.保留2位小數(shù)
a=2.300
a=as.numeric(sprintf(“%.3f”,a))
28。調出假設檢驗的p value
t.test(data1,data2)$p.value
R語言常用函數(shù)整理本篇是基礎篇,即R語言自帶的函數(shù)。
vector:向量
numeric:數(shù)值型向量
logical:邏輯型向量
character;字符型向量
list:列表
data.frame:數(shù)據(jù)框
c:連接為向量或列表
length:求長度
subset:求子集
seq,from:to,sequence:等差序列
rep:重復
NA:缺失值
NULL:空對象
sort,order,unique,rev:排序
unlist:展平列表
attr,attributes:對象屬性
mode,class,typeof:對象存儲模式與類型
names:對象的名字屬性
字符型向量 nchar:字符數(shù)
substr:取子串 format,formatC:把對象用格式轉換為字符串
paste()、paste0()不僅可以連接多個字符串,還可以將對象自動轉換為字符串再相連,另外還能處理向量。
strsplit:連接或拆分
charmatch,pmatch:字符串匹配
grep,sub,gsub:模式匹配與替換
complex,Re,Im,Mod,Arg,Conj:復數(shù)函數(shù)
factor:因子 codes:因子的編碼 levels:因子的各水平的名字 nlevels:因子的水平個數(shù) cut:把數(shù)值型對象分區(qū)間轉換為因子
table:交叉頻數(shù)表 split:按因子分組 aggregate:計算各數(shù)據(jù)子集的概括統(tǒng)計量 tapply:對“不規(guī)則”數(shù)組應用函數(shù)
dev.new() 新建畫板
plot()繪制點線圖,條形圖,散點圖.
barplot( ) 繪制條形圖
dotchart( ) 繪制點圖
pie( )繪制餅圖.
pair( )繪制散點圖陣
boxplot( )繪制箱線圖
hist( )繪制直方圖
scatterplot3D( )繪制3D散點圖.
par()可以添加很多參數(shù)來修改圖形
title( ) 添加標題
axis( ) 調整刻度
rug( ) 添加軸密度
grid( ) 添加網(wǎng)格線
abline( ) 添加直線
lines( ) 添加曲線
text( ) 添加標簽
legend() 添加圖例
+, -, *, /, ^, %%, %/%:四則運算 ceiling,floor,round,signif
1、round() #四舍五入
例:x - c(3.1416, 15.377, 269.7)
round(x, 0) #保留整數(shù)位
round(x, 2) #保留兩位小數(shù)
round(x, -1) #保留到十位
2、signif() #取有效數(shù)字(跟學過的有效數(shù)字不是一個意思)
例:略
3、trunc() #取整
floor() #向下取整
ceiling() #向上取整
例:xx - c(3.60, 12.47, -3.60, -12.47)
trunc(xx)
floor(xx)
ceiling(xx)
max,min,pmax,pmin:最大最小值
range:最大值和最小值 sum,prod:向量元素和,積 cumsum,cumprod,cummax,cummin:累加、累乘 sort:排序 approx和approx fun:插值 diff:差分 sign:符號函數(shù)
abs,sqrt:絕對值,平方根
log, exp, log10, log2:對數(shù)與指數(shù)函數(shù)
sin,cos,tan,asin,acos,atan,atan2:三角函數(shù)
sinh,cosh,tanh,asinh,acosh,atanh:雙曲函數(shù)
beta,lbeta,gamma,lgamma,digamma,trigamma,tetragamma,pentagamma,choose ,lchoose:與貝塔函數(shù)、伽瑪函數(shù)、組合數(shù)有關的特殊函數(shù)
fft,mvfft,convolve:富利葉變換及卷積
polyroot:多項式求根
poly:正交多項式
spline,splinefun:樣條差值
besselI,besselK,besselJ,besselY,gammaCody:Bessel函數(shù)
deriv:簡單表達式的符號微分或算法微分
array:建立數(shù)組
matrix:生成矩陣
data.matrix:把數(shù)據(jù)框轉換為數(shù)值型矩陣
lower.tri:矩陣的下三角部分
mat.or.vec:生成矩陣或向量
t:矩陣轉置
cbind:把列合并為矩陣
rbind:把行合并為矩陣
diag:矩陣對角元素向量或生成對角矩陣
aperm:數(shù)組轉置
nrow, ncol:計算數(shù)組的行數(shù)和列數(shù)
dim:對象的維向量
dimnames:對象的維名
rownames,colnames:行名或列名
%*%:矩陣乘法
crossprod:矩陣交叉乘積(內積)
outer:數(shù)組外積
kronecker:數(shù)組的Kronecker積
apply:對數(shù)組的某些維應用函數(shù)
tapply:對“不規(guī)則”數(shù)組應用函數(shù)
sweep:計算數(shù)組的概括統(tǒng)計量
aggregate:計算數(shù)據(jù)子集的概括統(tǒng)計量
scale:矩陣標準化
matplot:對矩陣各列繪圖
cor:相關陣或協(xié)差陣
Contrast:對照矩陣
row:矩陣的行下標集
col:求列下標集
solve:解線性方程組或求逆
eigen:矩陣的特征值分解
svd:矩陣的奇異值分解
backsolve:解上三角或下三角方程組
chol:Choleski分解
qr:矩陣的QR分解
chol2inv:由Choleski分解求逆
,,=,=,==,!=:比較運算符 !,,,|,||,xor():
邏輯運算符 logical:
生成邏輯向量 all,
any:邏輯向量都為真或存在真
ifelse():二者擇一 match,
%in%:查找
unique:找出互不相同的元素
which:找到真值下標集合
duplicated:找到重復元素
optimize,uniroot,polyroot:一維優(yōu)化與求根
if,else,
ifelse,
switch:
分支 for,while,repeat,break,next:
循環(huán) apply,lapply,sapply,tapply,sweep:替代循環(huán)的函數(shù)。
function:函數(shù)定義
source:調用文件 ’
call:函數(shù)調用 .
C,.Fortran:調用C或者Fortran子程序的動態(tài)鏈接庫。
Recall:遞歸調用
browser,debug,trace,traceback:程序調試
options:指定系統(tǒng)參數(shù)
missing:判斷虛參是否有對應實參
nargs:參數(shù)個數(shù) stop:終止函數(shù)執(zhí)行
on.exit:指定退出時執(zhí)行 eval,expression:表達式計算
system.time:表達式計算計時
invisible:使變量不顯示
menu:選擇菜單(字符列表菜單)
其它與函數(shù)有關的還有:
delay,
delete.response,
deparse,
do.call,
dput,
environment ,
formals,
format.info,
interactive,
is.finite,
is.function,
is.language,
is.recursive ,
match.arg,
match.call,
match.fun,
model.extract,
name,
parse 函數(shù)能將字符串轉換為表達式expression
deparse 將表達式expression轉換為字符串
eval 函數(shù)能對表達式求解
substitute,
sys.parent ,
warning,
machine
cat,print:顯示對象
sink:輸出轉向到指定文件
dump,save,dput,write:輸出對象
scan,read.table,readlines, load,dget:讀入
ls,objects:顯示對象列表
rm, remove:刪除對象
q,quit:退出系統(tǒng)
.First,.Last:初始運行函數(shù)與退出運行函數(shù)。
options:系統(tǒng)選項
?,help,help.start,apropos:幫助功能
data:列出數(shù)據(jù)集
head()查看數(shù)據(jù)的頭幾行
tail()查看數(shù)據(jù)的最后幾行
每一種分布有四個函數(shù):
d―density(密度函數(shù)),p―分布函數(shù),q―分位數(shù)函數(shù),r―隨機數(shù)函數(shù)。
比如,正態(tài)分布的這四個函數(shù)為dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。下面我們列出各分布后綴,前面加前綴d、p、q或r就構成函數(shù)名:
norm:正態(tài),
t:t分布,
f:F分布,
chisq:卡方(包括非中心)
unif:均勻,
exp:指數(shù),
weibull:威布爾,
gamma:伽瑪,
beta:貝塔
lnorm:對數(shù)正態(tài),
logis:邏輯分布,
cauchy:柯西,
binom:二項分布,
geom:幾何分布,
hyper:超幾何,
nbinom:負二項,
pois:泊松
signrank:符號秩,
wilcox:秩和,
tukey:學生化極差
sum, mean, var, sd, min, max, range, median, IQR(四分位間距)等為統(tǒng)計量,
sort,order,rank與排序有關,
其它還有ave,fivenum,mad,quantile,stem等。
R中已實現(xiàn)的有chisq.test,prop.test,t.test。
cor,cov.wt,var:協(xié)方差陣及相關陣計算
biplot,biplot.princomp:多元數(shù)據(jù)biplot圖
cancor:典則相關
princomp:主成分分析
hclust:譜系聚類
kmeans:k-均值聚類
cmdscale:經(jīng)典多維標度
其它有dist,mahalanobis,cov.rob。
ts:時間序列對象
diff:計算差分
time:時間序列的采樣時間
window:時間窗
lm,glm,aov:線性模型、廣義線性模型、方差分析
quo()等價于quote()
enquo()等價于substitute()
R軟件不只是一種統(tǒng)計工具,它還是一種語言,就語法形式而言跟S語言非常相識。所以類似與數(shù)據(jù)庫一樣,在客戶端不是就只能調用一些函數(shù),而是可以用數(shù)據(jù)庫提供的SQL語言編寫出擁有靈活多變,滿足各種需求的功能。R語言也一樣,可以在客戶端,用S語言編寫程序,傳送到R軟件,R軟件計算完成后將結果在傳回C#
。既然需要來回傳送,必然需要中間的橋梁,就像數(shù)據(jù)庫需要驅動程序一樣,在C#中調用R軟件,需要安裝R(D)COM,R(D)COM是一種DCOM組件,可以注冊到Windows的組件服務中,供程序調用。如果用C#開發(fā)Web程序,由于ASP.NET是用ASPNET這個用戶在執(zhí)行,而這個用戶的權限很低,所以如果要調用R(D)COM的服務的化,需要給ASPNET授予權限。
所有具體的操作,使用方法,可以參考: