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dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

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為了探究miRNA在腫瘤發(fā)生與發(fā)展中的角色,有過去的幾十年間,有很多的文章和數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)表,通過整合公開發(fā)表的數(shù)據(jù),dbDEMC的開發(fā)團隊提供了一個在線網(wǎng)站,可以方便的查詢在某種腫瘤中特定miRNA的表達趨勢,網(wǎng)址如下

http://www.picb.ac.cn/dbDEMC/

該數(shù)據(jù)庫目前收錄了2224個miRNA, 36種腫瘤,73種腫瘤亞型,209個miRNA在腫瘤中的表達譜數(shù)據(jù),示意如下

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫
其中乳腺癌的相關(guān)記錄是最多的,各個腫瘤比例如下圖所示

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

通過Search功能,可以針對特定的miRNA進行檢索,只需要輸入miRNA的ID即可,檢索框示意如下

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

檢索結(jié)果如下所示,給出了相關(guān)的GEO編號,腫瘤類型,細胞系,上下調(diào)趨勢等信息

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

通過Browse功能,可以通過腫瘤類型瀏覽相關(guān)記錄,示意如下

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

結(jié)果以Experiment為單位進行展示,示意如下

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

勾選最后一列的單選框,通過View miRNAs按鈕,可以查看具體的miRNA列表。

通過meta-profiling功能,可以查看miRNA在特定實驗中的表達譜數(shù)據(jù),結(jié)果以熱圖進行展示,示意如下

dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫

通過該數(shù)據(jù)庫,可以方便的檢索已有的miRNA在腫瘤領(lǐng)域的相關(guān)研究,不論是前期調(diào)研,還是后期根據(jù)自己的數(shù)據(jù)進行驗證,都非常的有用。

以上是“dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道!


文章標題:dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫
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