如何分析KEGG COMPOUND 數(shù)據(jù)庫，相信很多沒有經(jīng)驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現(xiàn)的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。

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kegg compound 數(shù)據(jù)庫存儲了在生命活動中發(fā)揮作用的各種小分子，生物大分子和其他類型的化學物質(zhì)，采用C number 進行標識，比如C00047,  代表L-賴氨酸。除了名稱等信息外，還存儲了該物質(zhì)的化學結構和其他相關信息；

對于所有compound 的分類詳見 Brite 數(shù)據(jù)庫

包括有機酸, 脂類， 碳水化合物， 核酸，肽鏈，維生素和輔助因子，類固醇，激素和遞質(zhì)，抗生素共9大類別；

看下每條記錄的詳細信息，以甲酸C000為例

http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?cpd:C00058

上面的信息可以分成兩大類：

1.基本信息

2.與其他數(shù)據(jù)庫的鏈接

Reaction 數(shù)據(jù)庫存儲的是各種compound 之間的反應，所以會有Reaction的鏈接，比如 R00134

Pathway 數(shù)據(jù)庫整合了ko, module, reaction, compound 等多個數(shù)據(jù)庫庫的信息，所以也會給出compound  參與的通路，在通路中，對應的compound 會高亮顯示， 如下圖中紅色標記的圓形。

Module 是ko的集合，但是ko只是基因集，真正參與生命活動的是這些基因的產(chǎn)物，在產(chǎn)物發(fā)揮作用的時候，也需要compound 的參與，所有會給出compound 相關的module。

Enzyme 數(shù)據(jù)庫保存各種酶的相關信息，酶作為催化劑調(diào)控一些生物學過程的發(fā)生和進行，在這個過程中肯定也會有compound 的參與；比如1.1.1.306 這種酶催化的反應中， 供體提供甲酸才能進行反應，所以會給出compound 對應的Enzyme 編號；

1. compound 數(shù)據(jù)庫存儲了參與生命活動的各種分子的信息，數(shù)據(jù)庫中的記錄用C Number唯一標識， 每條分子都有對應的化學式，結構式，分子量等基本信息；

2. compound 和reaction , module， pathway， enzeme 等多個數(shù)據(jù)庫都有聯(lián)系；

看完上述內(nèi)容，你們掌握如何分析KEGG COMPOUND 數(shù)據(jù)庫的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內(nèi)容，歡迎關注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，感謝各位的閱讀！